对于包皮起水泡的症状，考虑到可能是由于疱疹疾病，这种症状是由于细菌感染引起的，治疗包皮长的情况，然后外用盐酸利多卡因软膏，综合治疗才可以达到治疗的效果。治疗期间，要保持局部卫生清洁干燥，勤换洗内裤，饮食上也要保持清淡。
包皮上有水泡可以进行药物治疗、日常护理。
1.药物治疗：如果是因为包皮龟头炎，或者是因为不爱干净而出现了包皮上的水疱，可以服用阿莫西林胶囊，然后涂上红霉素软膏。也有可能是因为生殖器疱疹引起的，可以在患部涂上伐昔洛韦软膏，配合使用伐昔洛韦片。
2.日常护理：在这个阶段，尽量避免同房，避免食用辛辣、刺激性的食品，也避免用双手搔抓，避免引起其它的炎症。
包皮上的水泡可能有类似症状是龟头炎和生殖器疱疹。然而，龟头炎很容易处理。治疗后，应注意自己的健康习惯，注意饮食习惯。然而，生殖器疱疹极难治疗，并且是一种往往会复发的性传播疾病。在生殖器疱疹的早期发作中，受影响的区域是灰白色或黄白色。
包皮过长、手淫，创伤性感染等，导致剥离角质化上皮和腺体分泌，对其他细菌形成一个良好的生育条件，引起炎症，其临床表现是更常见的在当地的瘙痒，红肿，侵蚀，溃疡，严重的发烧、发冷、，甚至可以看到阴茎的肿大和疼痛。定期清洁包皮和阴茎头，保持包皮腔干净干燥。包皮过长或包茎应行包皮环切术。应避免清淡饮食，避免辛辣食物。
应该是生殖器疱疹。生殖器疱疹即发生于生殖器部位的单纯疱疹，是病毒性传染性皮肤疾病，中医属于热疮的范畴。与发生于口角处的单纯疱疹不同，绝大多数通过性关系传染。据有关报道，国外性活跃的青年患生殖器疱疹的很多，发病率甚至高于梅毒、淋病。