病毒疣具体的治疗方式也各不相同，所以也不能确定哪一种是最好的。
目前疣的治疗方法有冷冻、电灼、激光、外用药物等。其目的是破坏疣体，调节局部皮肤生长，刺激局部或全身的免疫应答。
治疗要考虑疣的类型、年龄、治疗史和治疗效果，任何一种治疗都要在2~3个月内进行。注意并不是全部疣都要治疗，有些疣如果不经过处理就会自动消退。
病毒疣一般指疣，一般是通过外用药物和物理疗法来进行治疗。
外用药一般是针对大面积的皮疹或者是难以进行物理治疗的，具体的用药和方法也会有所不同。维A酸软膏主要用于治疗扁平疣，对顽固性跖疣，平阳霉素、5-氟尿嘧啶注射液均能引起疣体萎缩、脱落。对于皮疹数量较小的患者，一般采用冷冻、电灼、刮除、激光等物理治疗。
病毒疣一般指疣，使用药物治疗、微波治疗等效果较好。
疣的治疗效果较好，经过积极的治疗，有根治的可能，临床常用的药物有氟尿嘧啶软膏、水杨酸、斑蝥素、平阳霉素等，患者也可以采用微波治疗，使机体组织在很小的范围内瞬间产生高温，从而使其发生坏死，起到治疗效果。
临床上常见治疗病毒疣的方法有物理治疗、药物治疗、手术治疗。
病毒疣是病毒性皮肤病，该病有极强的传染性，一般患病毒疣后，患处皮肤表面会长出明显的小疣体，无瘙痒感，呈圆形或椭圆形，会随着挠抓的痕迹生长。
治疗方法主要可通过激光、冷冻、注射干扰素等方法去除疣体。如果疣体较大，还可使用手术方法切除。
病毒疣主要有药物治疗、冷冻治疗、微波治疗等。
1.药物治疗：咪奎莫特软膏、氟尿嘧啶软膏、水杨酸等都能治疗病毒疣。
2.冷冻疗法：用液态氮使疣体坏死脱落，治疗后会出现水疱，皮肤变色，一般在几天内就会消失。
3.微波疗法：使组织内分子快速运动、变化，产生摩擦，使机体组织在较小范围内产生高温，造成坏死，彻底清除病毒组织，减少复发。
建议患者在医生的指导下严格按照医生的嘱咐用药，不能盲目用药。