在怀孕期间出现人乳头瘤病毒感染，如果是高危险的容易引起宫颈发生病变。
对于高危的人乳头瘤病毒感染，通常采用宫颈锥切等方法，会影响生育能力，因此对于没有生育能力的妇女，现代提倡系统化、规范化的治疗方法。通常建议分娩后根据宫颈的情况决定治疗方案。
三个月如果没有自动转阴，那就需要做阴道镜来检查宫颈，如果是低危型的容易引起尖锐湿疣，需要密切观察。在怀孕早期出现这种情况是需要引起重视的。当然很多人在一生中都感染过人乳头病毒，但是在短时间内转阴之后不会造成严重的后果。
人乳头瘤病毒阳性可以进一步做TCT和阴道镜的检查，根据阴道镜的检查结果决定怎么治疗。如果阴道镜检查发现宫颈癌前病变中度以上，可能需要做宫颈锥切手术。如果阴道镜提示宫颈没有看到明显的异常，平时增加抵抗力，抵抗力增加了，体内的免疫系统可能帮助清除这个病毒，半年后可以复查HPV病毒。
人乳头瘤病毒阴性并不需要治疗。
人乳头瘤病毒阴性表示并未感染人乳头瘤病毒，是正常的现象，患者无需进行治疗。如果有过高危性行为或者性伴侣患过尖锐湿疣，存在被感染的风险，则建议每半年定期检查一次。平时要注意性生活前后的局部卫生，平时还应避免不洁的性生活。
感染人乳头瘤病毒（HPV）是通过性接触传播的，其他传播方式少见，对于尖锐湿疣(感染HPV)的治疗需要局部用药和全身用药。如果外阴有尖锐湿疣，需要通过物理治疗方式摘掉，然后用增强免疫力的药物，是阴道用药。再加上抗炎药，综合治疗，治疗期间禁性生活，防止相互传染。一般六个月后复查人乳头瘤病毒为阴性。
该病极强的传染性也将威胁家中伴侣、老人及孩子的健康，如果治疗不及时，在将来很可能导致女性宫颈癌等恶性肿瘤，一定要引起高度重视。可以到医院进行检查，给予针对性治疗。
人乳头瘤病毒反复感染可采用物理治疗：目的去除肉眼可见的瘤体和亚临床感染。方法包括：激光、微波、冷冻、电灼、手术切除（妇科的LEEP刀等）、光动力疗法等。也可以选择药物治疗。
