HPV可能没有明显的症状，也可能伴有妇科炎症的症状。
在潜伏期可能没有特别和显著的不舒服的表现，但由于病毒的数量增加，患者会出现白带增多、外阴瘙痒等症状。如果是HPV的高危类型，并且连续感染超过2年，发生了宫颈癌的癌前病变，那么就有可能会发生性出血，比如同房后出血。
HPV初期可能会有瘙痒的症状。
HPV是人乳头瘤病毒，患者感染HPV后，可能会有红色丘疹、瘙痒等症状。感染初期是细而小的淡红色的丘疹，随着病情加重，皮损会逐渐的增大和增多，并且表面还会呈隆起菜花样的状态，建议患者及时前往正规医院，在医生指导下使用合适的药物进行治疗。
女性感染HPV是人乳头瘤病毒的一种表现，刚开始时并不觉得，随疾病进展，一般表现为白色分泌物增加伴恶臭，会伴有腥臭气味或下腹部酸痛等症状。
如果出现上述症状，患者应在适当时候去医院进一步检查，对HPV治疗可以局部使用氟尿嘧啶，α-干扰素，阿昔洛韦，左旋咪唑。
HPV的类型很多，口腔感染HPV的症状，比较严重的有口腔癌，初期症状表现为黏膜充血血肿，呈颗粒状红点，灼痛明显，继而形成浅表溃疡，圆形或椭圆形，严重后可形成瘢痕或组织缺损。
感染HPV病毒不同亚型，前期症状不一。如HPV6型，HPV11型的感染等，初期有外阴瘙痒、白带增多的表现等。若感染高危型HPV病毒，发病初期病人通常无明显症状，患者容易自身病情，随着疾病的加重，患者可能会出现腹痛、少量阴道流血等，此时可能是宫颈发生癌变引起的。
男性HPV病毒的早期症状就是皮肤上出现一些细小的疣状新生物。HPV病毒又称人类乳头瘤病毒，它具有多种亚型，不同亚型可导致不同皮肤疾病。有些丘疹是扁平的，质地较硬的丘疹，颜色呈黄褐色或棕褐色，属于扁平疣。也有一些硬质小丘疹，感染手背形成角质增生，称为寻常疣。
另外，尖锐湿疣是一种性传播疾病，也是由人乳头瘤病毒感染引起的。早期表现为单发或多发小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，表面湿润，可呈正常肤色或淡红色。如果不加以治疗，它们会逐渐长大、融合，形成乳头状、鸡冠状、菜花状的小疣状生物。