根据患者的症状表现一般表现为，外生殖器或肛门周围有群簇或散在的小水疱，2～4天后破溃形成糜烂或溃疡，自觉疼痛。病毒培养，核酸检测：通过聚合酶链反应（PCR）等方法检测HSV-2核酸。
可以通过免疫组织学检查：常用过氧化物酶抗过氧化物酶方法即PAP，显示湿疣内的病毒蛋白，以证明疣损害中有病毒抗原。HPV蛋白阳性时，尖锐湿疣的浅表上皮细胞内可出现淡红色的弱阳性反应。
生殖感染通常可以通过完善检查进行诊断。
生殖感染通常指生殖器官在受到各种病原体侵袭感染后发生炎症，比如外阴炎、宫颈炎、阴道炎、淋病、梅毒等。如果生殖感染的患者想要明确病情，可以到医院做阴道分泌物检测、宫颈分泌物检查、查体、B超检查等检查。患者在明确病情后再对症治疗。
生殖感染检查主要包括实验室检查和影像学检查。
白带检查、妇科超声检查、宫颈刮片检查三大类。阴道内分泌物比较多，需要检查白带常规、细菌、真菌、病毒等。
妇科彩色多普勒超声对子宫及附件及盆腔积液的诊断有重要意义。宫颈刮片检查可以检查宫颈周围脱落的细胞，这样才能尽早发现宫颈癌。
临床表现典型损害为生殖器部位的群簇性粟粒大水疱、糜烂、溃疡、自觉灼痛，近卫淋巴结肿大，诊断并不困难。但临床表现不典型的相当多，应当认真询问病史和细心观察，有时可找到些线索。至于无症状的亚临床感染者，只有依据特异的实验检查来确认。但目前临床上尚缺少实用的检测手段。
外染毒邪型：这一情况是最为直接的，尖锐湿疣本身就是一种性病；湿热下注型：中医讲的是人的身体属于或寒性或湿性，所以对尖锐湿疣的湿热下注型，中医认为本型好发于素体肥胖，阴部潮湿者，多因肝胆湿热下注，循经流注阴部所致。