病毒疣具体的治疗方式也各不相同，所以也不能确定哪一种是最好的。
目前疣的治疗方法有冷冻、电灼、激光、外用药物等。其目的是破坏疣体，调节局部皮肤生长，刺激局部或全身的免疫应答。
治疗要考虑疣的类型、年龄、治疗史和治疗效果，任何一种治疗都要在2~3个月内进行。注意并不是全部疣都要治疗，有些疣如果不经过处理就会自动消退。
病毒疣一般指疣，一般是通过外用药物和物理疗法来进行治疗。
外用药一般是针对大面积的皮疹或者是难以进行物理治疗的，具体的用药和方法也会有所不同。维A酸软膏主要用于治疗扁平疣，对顽固性跖疣，平阳霉素、5-氟尿嘧啶注射液均能引起疣体萎缩、脱落。对于皮疹数量较小的患者，一般采用冷冻、电灼、刮除、激光等物理治疗。
病毒疣一般指疣，使用药物治疗、微波治疗等效果较好。
疣的治疗效果较好，经过积极的治疗，有根治的可能，临床常用的药物有氟尿嘧啶软膏、水杨酸、斑蝥素、平阳霉素等，患者也可以采用微波治疗，使机体组织在很小的范围内瞬间产生高温，从而使其发生坏死，起到治疗效果。
病毒疣这个一般会感染人类的皮肤和表层黏膜。有高度的特异性，生长在生殖器官附近皮肤和黏膜上的人类寻常疣、尖锐湿疣以及生长在黏膜上的乳头状瘤。病毒疣一般只能对症治疗，激光冷冻治疗即可，主要是要提高免疫力，因为这个是病毒感染，只有靠免疫力将病毒打败才是最根本的方法。
病毒疣由HPV病毒感染而来，HPV病毒寄生在正常人体表面，需积极治疗。
病毒疣指感染人乳头状瘤病毒后皮肤黏膜部位出现疣状赘生物的一种疾病，病人可以根据医生指导使用鬼臼毒素或咪喹莫特进行治疗，可以改善患者瘙痒不适的症状，如果不积极治疗，症状可能会长时间持续，还可能引起宫颈病变。