肛门疣属病毒感染性疾病，主要是通过性活动传播。接触有人类乳头瘤病毒病原体的物体如个人卫生用品、公共卫生用品会造成接触传染。不要抓挠病灶部位，个人卫生，内衣、裤单独洗。要休息，特别是要精神放松。
主要是切除疣体，再加上抗病毒治疗。尖锐湿疣多通过高频电切、电凝的方式将疣体切除，涂些药物保护创面，预防感染，后续反复发作的话，需要多次切除。再在专业医师指导下，定期注射一些必用药物，经规范治疗后，一般可以治好。注意治疗期间不要与配偶同房，以免传染。
治疗周期要看病人的严重程度，和治疗方式。尽量选择正规医院或者是国家三甲医院就诊，循序治疗才能控制病情，千万不能因为急于求医而盲目治疗，一旦用药不当或者不对症的话，就有可能造成病情加重，甚至会发展为恶性肿瘤，病人期间应该注意肛门清洁卫生，注意忌辛辣刺激食物，饮食清淡规律避免便秘。
应该进行药物治疗。以局部用药为主，每天涂药多次，七天左右可以愈合，不需吃药打针挂水等全副身心性治疗，激光、冷冻等常规的物理方法治标不治本，单独用多在短期内复发，可配合伤口涂药达到彻底愈合。要引起重视，以免加重病情。忌口海鲜、鸡蛋。勤更换内裤，清水冲洗，不可以用洗涤用品清洗皮肤避免加重过敏症状。一般半个月会自愈。
肛门疣初期的症状为小的淡红色丘疹，后逐渐长大，在治疗肛门疣之前注意护理，就能早日治疗病情，恢复到健康生活，虽然该病易反复发作，但只要在病情治疗期间，注意个人卫生，不发生性接触，是可以降低其发病的概率。