男性治生殖器疱疹的方法主要就是抗病毒处理治疗，另一方面就是配合一些中药清热利湿解毒治疗。早发现早点去处理的，而且可以引起性伴侣的一个感染的时间久可以迁延不愈的，治疗期间应该注意饮食。
根据患者的症状表现一般表现为，外生殖器或肛门周围有群簇或散在的小水疱，2～4天后破溃形成糜烂或溃疡，自觉疼痛。病毒培养，核酸检测：通过聚合酶链反应（PCR）等方法检测HSV-2核酸。
生殖器疱疹要治疗半个月能恢复。生殖器疱疹的治疗标准是6个月未复发，血测抗体检查3-4次均为阴性即为临床治疗。生殖器疱疹很容易复发，生殖器疱疹治疗后三个月是其复发高峰，随着时间的延长，复发的可能性降低，传染性也降低。所以说经过治疗后六个月没有复发，就算是临床治治好，如果一年没有复发，那么以后的复发可能性就很小。
生殖器疱疹是一种由于单纯疱疹病毒导致引起的一种性传播疾病，这个疾病容易反复发作。对于生殖器疱疹来说，一般要采用抗病毒的治疗比如阿昔洛韦，但是初发跟复发的治疗疗程剂量也是不一样的。对于生殖器疱疹，一定要保持心态良好，对治疗要积极配合，保持日常卫生从而防止传播，早日康复。
建议及时到三甲医院就诊。在疱疹早期发病的时候，会有一些成群的小丘疹，还会时不时地伴有瘙痒或者是灼热的感觉。情况严重的就会出现溃烂，尽管这些症状在2-3周内会逐渐消退，可是还有复发的可能。生殖器疱疹及易感人群必须引起高度重视，对生殖器疱疹进行，遏制癌变。性行为当中安全套是无法做到百分百“安全”。所以在患病中要禁止同房，以避免交叉感染。
只要体内检测没有疱疹病毒就算治好。但是如果检测出来还是阳性，说明体内还是有病毒，还会复发的。本身这个疾病主要是因为感染疱疹病毒引起的。所以建议还是正规的定期复查疱疹病毒检测。