阴茎短小根本的原因是遗传基因的影响。另外包皮过长会阻碍阴茎的发育。后天性的阴茎短小，主要是因睾丸萎缩引起，青少年发育期间摄入的锌原素、雄性激素、维生素E和相关蛋白营养不足，缺乏后天能量补充，起不到壮大性器官的作用。
阴茎大小和个人体质遗传有关系，正常成人的阴茎在疲软状态下有7-9厘米，勃起以后大概就是11-16厘米。如果疲软状态下小于5厘米，而且勃起时小于10厘米，才能叫阴茎短小。作为大多数男性来讲，性成熟期是18周岁，基本发育就差不多了。
男人的阴茎的长短与种族、家族、遗传、以及青春期营养状况、地域、个体差异等有关。一般来讲，阴茎主要在青春期发育，过了青春期基本不再生长。如果要想增长，只有靠手术来延长或植入假体，药物或其他方法延长的可能性不大。所以阴茎短小患者在饮食上并没有特别的注意，平时注意避免辛辣刺激。
假阴茎短小症：指阴茎在非勃起状态下，固然长度小于3cm，但在勃起状态下却能明显地延长、增粗2~3倍，且不影响性生活。潜伏阴茎：指阴茎虽貌似短小，但用手向后推压阴茎旁皮肤时，可露出正常大小的阴茎。
平常的状态下不能超过四个厘米，或者勃起以后不能超过九个，里面就是一件短小的，需要到医院进行检查明确下诊断，如果确实是有一件短小的情况，还是需要积极的寻找原因。需要进行治疗。
如果想通过食疗来改善阴茎短小的症状，可以多吃狗肉、羊肉、动物内脏、牡蛎、黑芝麻、核桃、坚果等食物，这些食物应该还有一些用处。由于种族、遗传、先天发育和后天发育的影响，每个人阴茎的长度和大小是不同的。