引起阴茎短小的原因主要是阴茎先天性的发育不良，包括包茎，隐匿性阴茎。也有可能是由于海绵体的病变导致海绵体萎缩，海绵体硬化，出现阴茎短小。多见于阴茎外伤，或者是高血压糖尿病。
一般情况下，阴茎短小最明显的症状就是阴茎大小没有达到正常范围。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
阴茎短小是指在软弱状态下阴茎小于4厘米或在勃起时小于8厘米。阴茎短小属于外生殖器发育不良，主要是由于睾丸组织功能不好，分泌雄激素水平低，导致外生殖器发育迟缓。如果阴茎勃起不超过5厘米，建议做阴茎延长手术。
根据孩子的症状，应该属于假性隐匿性阴茎，有可能是先天发育异常造成的，也有可能是孩子肥胖等原因造成的。对于孩子现在的情况，是不需要进行治疗的，如果青春期后还有隐匿性阴茎的症状，可以手术进行治疗，你家孩子要合理喂养，适当的补充维生素D。
只要有男性成熟的精子进入到女性的体内，就可以导致女性怀孕的，所以即使是有阴茎短小症，但是如果精子质量正常的话，那么就不会影响到怀孕的。这情况无需担心，可以正常的备孕的。阴茎短小症如果已经确诊的话，可以考虑通过手术来治疗。
引发阴茎短小的常见原因阴茎的大小与其营养也有关系，体格健壮，身材高大的男性，阴茎的发育情况比较好，阴茎会显的粗大。生殖器在勃起后10厘米左右都是属于正常的情况。可以多注意观察，平时多注意个人卫生，勤换内衣都是可以进行改善的。
阴茎短小，先去医院抽血化验性腺系列。如果正常，最常见病因就是手淫和包皮过长，尽快彻底戒掉手淫，手淫导致发育期发育不良或者停止，阴茎海绵体挫伤，阴茎越来越短小，增加营养，多吃高蛋白食物，牛羊肉，海参，另外包皮过长、肥胖也是阴茎短小病因，如果有包皮过长割掉包皮，肥胖必须减肥，对发育期阴茎发育有好处。