前列腺囊肿的治疗较小而无症状的囊肿，只要不继发感染等，可不必治疗，只是要注意动态观察其变化即可。较大的囊肿或有症状的小囊肿可用手术治疗，治疗后饮食上需要注意清淡，不要吃辛辣的食物，多喝水有利于新陈代谢。
采用以下方法调节。手术治疗：对于近尿道或突入膀胱的囊肿，经尿道电切除囊肿则是手术最佳途径，但是对于年轻患者，保留精阜对正常射精至关重要。对症治疗：当患者持续高热不退、尿路症状无明显改善、尿道溢脓、大便不畅时，应考虑前列腺囊肿的可能，借助B超等检查确诊后行脓肿切开引流或穿刺引流治疗。
对前列腺脓肿行穿刺治疗：当持续高烧不退，尿路症状无明显改善，尿道溢脓，大便不畅时，应考虑前列腺囊肿的可能，借助B超等检查确诊后行脓肿切开引流或穿刺引流治疗。只有当脓肿彻底消灭之后，以上症状才会缓解。穿刺治疗比较简单，经肛门指诊，将一根长针头刺入脓腔内，用注射器抽吸直至脓汁完全吸净。
较大的囊肿或有症状的小囊肿可用手术治疗，途径有经膀胱、膀胱外、经会阴、经直肠等多种，常由于暴露欠佳致手术切除不完全，复发率高、并发症多，注意劳逸结合，防止过度疲劳，适当进行体育锻炼，尤其是加强盆腔肌肉的运动，避免长期久坐、骑自行车等。
像病人如果得了这种病，一定不要精神过于紧张，轻度比较小的前列腺囊肿没有症状，像不用治疗，因为对人体并没有什么太大的伤害，但是如果前列腺囊肿比较大，而且还有感染就会有较大的危害，并且没有什么特效药物。一般会有穿刺引流和手术的治疗方法。
一般行穿刺治疗前列腺囊肿引流术治疗前列腺囊肿。当脓腔较大、脓汁较多时，以脓腔切开引流为佳。理疗治疗前列腺囊肿的方法理疗对于急性前列腺炎及脓肿都是有帮助的。根据各个医院设备的条件及需要，进行合理应用能促进炎症吸收。如果没有理疗条件，用热水袋敷于耻骨上或会阴部，每次半小时左右，坚持数日疗效亦不错。