如果口腔溃疡反复发生，首先排除是否患有系统性疾病，比如口-眼-生殖器综合征。如果不是系统性疾病，只是单纯的复发性口腔溃疡，可以不采取治疗措施，半个月也会自动愈合。如果在患有口腔溃疡的过程中，疼痛比较明显，局部红肿或者淋巴结已经肿大，需要采取辅助的治疗措施。
口腔溃疡的发生与许多因素相关，如细胞免疫功能降低；腹胀、腹泻或便秘等消化系统疾病；内分泌变化；精神紧张、睡眠状况不佳等精神因素；缺乏微量元素锌、铁、叶酸、维生素B2、遗传等其他因素。平时应多吃流体食物，细嚼慢咽，适量增加水果和蔬菜的摄入量，以便补充多种维生素和矿物质。避免吃研磨后的食物，如面包末、玉米或土豆片，停止吸烟、少喝酒，少吃酸性食物如柑橘、西红柿或坚果，少吃过辣或过咸的食物，避免吃坚硬的。
复发性口腔溃疡是用药草进行医治口腔溃疡的疗效较为确切，可以口腔内外用冰硼散，不要吃刺激性的食物和发物。去除致病因素，增强体质，促进溃疡愈合，注意口腔卫生，勤刷牙。
复发性口腔溃疡可以吃一些含锌高的食物，同时服用锌来进行治疗口腔溃疡的情况，也是可以补充多种维生素，多吃水果，多吃蔬菜，不要吃辣性，刺激的食物，而且要多喝水，勤排尿。
常有口腔溃疡的情况，可以到口腔科的，多吃一些面食。而且平时要注意避免辛辣刺激的食物，注意多喝水，多吃水果，蔬菜。要注意生活规律，保持充足的睡眠，良好的情绪来改善。要注意增强体质，可以减少口腔溃疡发生。
治疗复发性口腔溃疡采取全方位数字自动分析仪，口腔，细菌培养，免疫检查这些来明确病因，针对性的治疗的，主要是因为免疫失衡引起的，要从中医角度去提升自身免疫力，先要找准病因，然后再针对性对因施治。