乙肝的治疗不是任何时候都可以抗病毒治疗的，病毒在肝细胞中，盲目的治疗会损害肝细胞，当乙肝病毒达到一定值，被免疫系统识别的时候，此时开始抗病毒治疗效果比较好，乙肝大三阳治疗时机是肝功能开始出现异常，转氨酶升高至正常的两倍，病毒上升到10的5次方，此时是治疗乙肝大三阳的好时机。
乙肝大三阳目前没有特效的药物和治疗方法，最有效的抗病毒治疗转阴率50%左右。如果肝功能异常（转氨酶升高两倍以上）则是抗病毒治疗的时机。除了用药外，在饮食上以清淡、易消化的食物为主，多吃水果蔬菜，保证食物的新鲜、营养。如果肝功能正常，可以暂时不用药，平时注意劳逸结合，饮食清淡均衡，不喝酒，定期复查动态了解肝脏变化情况。
乙肝大三阳一般可以选择当地大型三甲医院肝病内科就诊就主要是采取抗病毒和护肝来进行对症治疗，临床上主要是采取中西医相结合的治疗方法，对症治疗，有助于改善。大三阳也称为乙肝大三阳，主要是指乙肝表面抗原、乙肝e抗原、乙肝核心抗体三项检查项目为阳性，并且三项指标阳性说明人体体内病毒复制比较活跃，所以称为大三阳。大三阳只是人体内乙肝病毒的一种免疫状态，并不能说明患有大三阳就表示乙肝疾病很严重，还有查看病人的自觉症状和的肝功能状况。
乙肝大三阳，如果肝功能正常，无需治疗，只需定期复查腹部彩超、乙肝DNA、乙肝五项、肝功能、甲胎蛋白，如果正常，无需治疗，需注意休息，勿熬夜、劳累、忌食辛辣油腻食物，屏蔽饮酒，饮食上以清淡、易消化的食物为主，饮酒等。
大三阳的治疗方法主要是抗病毒，保肝，提高机体免疫力的治疗，平常饮食规律一些避免暴饮暴食，少食辛辣油腻性食物不要熬夜，不要抽烟喝酒，进行适量运动：适宜的多做些户外活动，可以怡情养肝，达到护肝保健目的。
治疗大三阳的费用与患者病情有关，一般是在5000至20000左右。如果患者的肝功能正常，单纯的乙肝大三阳则是乙肝携带者，不需要特殊治疗，只需定期复查。乙肝大三阳患者需要检查一下肝功以及病毒复制情况，比如大三阳的肝功检查一般100元左右，乙肝两对半定性检查50元左右，如果查定量每项40元左右，三项120元左右。如果肝功正常、病毒复制不活跃，多数无需治疗，如果病毒复制活跃、存在肝功能损害，需要使用抗病毒以及护肝药物治疗，而抗病毒需要长期服用，至少疗程4年以上，有部分人群需要终身服药，综合价格在1万元左右。