治疗丙肝的最佳方案通常是药物治疗。
抗病毒治疗通常是丙肝的第一选择，而口服小分子药物是抗病毒治疗的首选。根据丙肝病毒的基因型，可以选用多种抗病毒药物，有些针对某些基因型，有些针对全基因型，具体取决于病人的情况。丙肝的治疗要看效果，目前治疗丙肝的有效率在95%左右，一般情况下，副反应不大，大多数病人都能忍受，如果出现不舒服的情况，建议及时就医。
慢性丙肝的治疗，目前国内外公认有效的也只有一种药剂，而且应该早期治疗。在急性丙肝的恢复期，选用这种药剂每次300万单位，每周3次，皮下注射，持续一年，甚至更长时间，70％以上的可获痊愈，这可使慢性丙肝大大减少；若急性期未得到及时冶疗，则60％左右的感染者将发展为慢性丙肝，以后自愈的可能性甚少。对于慢性丙肝。
大都是普遍所采用抑制病毒，提高免疫力的治疗。反跳率高，病毒变异频发，白血球下降等不良因素有导致病情反复加重的可能，而中医中药可避免或降低这种反应。治疗丙肝采用中西医结合清楚病毒，初期以抗病毒为主，后期以保肝护肝为首。
要注意生活调理，注意养肝护肝，日常补充肝脏所需硒，硒对肝脏有保护作用。可以适量服用养肝片，进行养肝护肝，保护肝脏。护肝消除肝脏病毒排解肝脏内毒修复受损肝细胞恢复肝功能调节肝脏免疫力，保护肝脏：禁戒酒，不要过劳，保持心情舒畅，合理营养。
丙型肝炎病毒感染是致病的根本原因，丙肝目前临床上治疗主要是抗病毒治疗，在治疗前应明确病人的肝脏疾病是否由HCV感染引起，只有确诊为血清HCVRNA阳性的丙型病毒性肝炎病人才需要抗病毒治疗。