目前乙肝有很多的治疗方式，但是没有一种可以完全治好。乙肝抗病毒的治疗，如果是用核苷类的西药，一个疗程时间一般是两年以上。如果是用中药或中成药抗病毒治疗，至少也得半年左右。
用乙肝疫苗后多长时间能产生阳性的乙肝表面抗体，普遍认为，有些人在第一针后便能产生抗体，但也有可能要用2针或3针乙肝疫苗，才能产生抗体。第二，如果没有注射乙肝疫苗的话，那么即使是已经接种了四次也不会出现乙型肝炎表面抗原阴性的现象，因为乙肝病毒本身并不存在免疫应答能力。此外，即使3次乙肝疫苗也不能产生乙肝抗体，因此，推荐3次乙肝疫苗后服用，再过一至三个月做乙肝两对半，对乙肝表面抗体阳性与否进行评价。
目前乙肝很难治好，治好的部分人群仅仅集中在小三阳，大三阳目前无法治好。要定期复查，肝功能正常无需治疗，肝功能反复异常，要抗病毒治疗。乙肝大三阳，如果肝功能正常，无需治疗，只需定期复查腹部彩超、乙肝DNA、乙肝五项、肝功能、甲胎蛋白，如果正常，无需治疗，需注意休息，勿熬夜、劳累、饮酒等。
肝功能持久性不正常，也可能在3-5年时间就可以进展到肝脏肿瘤。乙肝病毒携带者，最关键的是需要保持肝脏功能的正常，很多由乙肝所导致的肝癌，主要是反复的肝脏损伤而出现肝细胞的癌变。
乙肝疫苗需接种三针，接种乙型肝炎疫苗后，有抗体应答者的保护效果至少维持十二年。
接种乙肝疫苗是预防hbv感染最有效的方法，除新生儿外，接种疫苗前均需先进行化验，如果乙肝表面抗原和表面抗体检查均为阴性，转氨酶正常就可以注射乙肝疫苗，一般在0、1、6个月时分别注射一次，此方案为016方案。如果新生儿的父母均没有乙肝，该新生儿出生后应在24小时内进行乙肝疫苗注射，新生儿注射部位为大腿前部外侧肌肉、儿童、成人为上臂三角肌，对于母亲一方为单纯表面抗原阳性的新生儿，最好接种乙肝疫苗联合应用高效价的乙肝免疫球蛋白，免疫成功的标志是乙肝表面抗体转为阳性。