乙肝小三阳典型的临床表现，如低热、乏力、食欲减退、恶心、呕吐、厌油、腹胀、肝区疼痛、尿黄如茶水样等，部分甚至可出现一过性大便颜色变浅，皮肤瘙痒、肝区压痛及叩痛等，而急性无黄疸型多较隐匿，症状轻，似有轻度乏力、纳差、恶心等不适，恢复较快，常常体检化验时才被发现。
乙肝小三阳，指乙肝五项检查中乙肝表面抗原、乙肝e抗体、乙肝核心抗体阳性，乙肝表面抗体、乙肝e抗原阴性，提示机体存在乙肝病毒感染，病毒处于静止期、传染性较小。是否需要治疗取决于肝脏有无炎症活动、有无纤维化进展。判断金标准为肝穿病理，但肝穿属于有创操作。
小三阳严重时除了局部能表现出一些症状之外，病人也会表现出一些全身症状，具体表现为容易倦怠、精神力不集中、嗜睡、浑身无力，更为严重者会出现便血、出血、流鼻血等症状。乙肝小三阳病人病情加重，会出现不明原因持续低热的现象，病毒处于活动时期，病人肝脏炎症加重，低热甚至会持续到病人出现黄疸后依然存在。
被确诊为乙肝小三阳的，在潜伏期或慢性肝炎活动期，多数伴有腹痛、体力不支、容易疲劳、疲倦、呕吐、恶心、食欲减少、转氨酶升高、伴随食欲不振、厌油、体力不够等症状。其中眼睛巩膜发黄，皮肤发黄，尿液发黄，也是乙肝小三阳的主要症状。
轻度肝炎性乙肝小三阳的临床症状：表现为容易出汗、嗜睡、口喝、看书眼睛容易疲劳等乙肝小三阳的临床症状。体内携带乙肝病，乙肝小三阳，体内乙肝病毒没有复制，传染性不强，会有厌油、食欲不振、下降、乏力、懒动、低烧等乙肝小三阳的临床症状。
乙肝小三阳只是一个血清学的标志，跟活的长久应结合病情关联。比如小三阳病毒定量是阴性，正常长期存活没有任何问题。如果是乙肝小三阳通过长期的吃抗病毒药以后，病毒定量也是阴性，这种病人也可以长期存活。但是如果是小三阳伴随有肝硬化失代偿期、肝硬化或者腹水以及肝性脑病、消化道出血，甚至最后导致原发性肝癌发生的情况下可能就会影响寿命的问题。