目前治疗乙肝主要是抗病毒治疗，可使用干扰素和核苷类似物。
两种药物各有优缺点。使用干扰素，既有抗病毒作用，也有免疫调节作用，且有一部分优选患者经过干扰素抗病毒治疗，疾病被治愈的几率较大，但这种比例较低，使用干扰素费用较贵，不良反应的发生率较高，会导致部分患者不耐受。使用核苷类似物，大部分患者都耐受，不良反应发生率也较低，但患者需要长期用药，部分患者需要终身用药。
因此，患者需根据自身情况，在专业医生的建议进行药物治疗。
乙肝的检查分为以下两个部分：
1、血清学标记物检查：乙肝两对半或者是乙肝七项；如果出现表面抗原、E抗原、E抗体、核心抗体等均为阳性，需要做乙肝DNA的检测，以了解病毒的复制和复制情况；如果DNA呈阳性，说明有感染，需要做肝功能、凝血功能、HBV基因分型等方面的检查；同时，乙型肝炎病人要定期做好甲胎球蛋白的检查，以防止肝癌的发生。
2、影像学：即时弹力成像是评价肝组织弹性的重要手段，间接评价肝纤维化、肝硬化的程度；同时进行腹部彩超，病情严重的可以进行CT、MRI等筛查，以明确早期的肝癌。
对于乙肝的治疗，现在多数是以口服抗病毒的药物为主，对于乙肝的传播主要是通过血液、母婴垂直传播、性接触等途径，并不是所有的乙肝都需要抗病毒治疗，对于乙肝病毒携带者，可以采取定期观察（肝功、病毒含量、超声、甲胎蛋白等）。
乙肝的治疗方法有两大类，一类是护肝降酶治疗，另一类是乙肝抗病毒治疗，护肝降酶治疗：主要用药；抗病毒治疗：核苷类抗病毒治疗每种抗病毒药都有其优点和缺点。必须在专科医师指导下才能使用。具体用药请结合临床。
乙肝治疗难度较大，对技术要求很高，选择专业的医院，保障治疗效果。同时在治疗的时候，应该避免治疗误区，考虑最新技术治疗，能有效清除体内病毒，修复受损肝细胞，可以转阴康复。
如果乙肝小三阳，病毒学检测也就是HBVDNA阴性，肝功酶学正常，彩超等影像学无任何改变，年龄小于50岁，无家族的肝癌病史，可以不用治疗，半年到一年一次系统检查。如果小三阳，HBVDNA高于检测线，肝功能异常，彩超提示肝硬化，或者肝脏结界，年龄大于50岁，家族有肝癌病史，尽早进行抗病毒治疗。