口腔溃疡的发病机制目前尚不明确，口腔溃疡的发生与免疫力低下，维生素缺乏感染有关，溃疡具有自限性，一般7~10天可以自愈，平时多吃蔬菜水果补充维生素，提高免疫力可以减少口腔溃疡的发生。
口腔溃疡等引起来的不适一般和维生素的缺乏免疫力下降，尽快去医院治疗，以及近段时间口腔过锐的牙齿残根不良刺激物的刺激等都有一定的关系。这段时间注意多休息，不要熬夜，少吃辛辣刺激性的食物，多吃些新鲜的瓜果蔬菜，尽早及时的治疗牙龈炎和龋齿，有时间还是多到户外活动，增强自身的免疫力。
想要根治口腔溃疡，要及时到口腔黏膜科进行治疗，通过中医辨证结合西医辨病，调节身体免疫平衡，利用中西医结合免疫平衡体系分清口腔粘膜疾病的类型，依据患者的个人体质一人一方，然后通过内外兼治，调理和巩固修复黏膜组织以及提高免疫力，调节新陈代谢，治疗口腔粘膜溃疡的问题。
尽量做到规律作息、保证睡眠、适当的进行体育锻炼、保持口腔清洁、饮食全面适度，多吃富含维生素和微量元素的食物，比如水果、蔬菜。同时做到不吸烟，不熬夜，去除口腔内的局部刺激因素，比如残冠、残根、不良修复体等，消除心理压力，减少和控制不良的情绪，减少口腔溃疡的复发率。
复发性口腔溃疡又称复发性口疮或阿弗他口炎，中医认为，本病多为肺肾阴亏，虚火上炎所为，当以养阴清热，引火归源为治，可吃些药物来治疗。平常应注意保持口腔清洁，常用淡盐水漱口，戒除烟酒，饮食清淡，多吃蔬菜水果，少食辛辣，厚味的刺激性食品，保持大便通畅。一般就不会复发了。
这主要与免疫力低下，维生素缺乏感染有关，溃疡具有自限性，一般7~10天可以自愈，要补充维生素，提高免疫力，可以有效的减少口腔溃疡的发生，反复发作的口腔溃疡可以适当的应用激素类药物进行治疗。