口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
口腔溃疡多般是由于上火、炎症、感染和免疫力低下以及缺乏维生素等原因造成的。对于其初期的治疗可以用口含片或者是喷剂进行治疗，另外要注意口腔卫生和饮食清淡，此外还可以适当补充b族维生素并多喝水。
药物治疗：配合中西类止疼消炎的药物来进行治疗。免疫力治疗：由于该病原因复杂，如果由免疫力降低引起，想缓解病情还得提高自身免疫力，必要多补充维生素，来补充流失掉的微量元素。
平时要吃蔬菜水果补充维生素，提高免疫力，可有效的减少口腔溃疡的发生。反复发生了口腔溃疡，可以适当的应用激素类药物进行治疗，平时不要吃辛辣刺激的食物。口腔溃疡的发生主要是与免疫力低下，维生素缺乏感染有关。
孕期口腔溃疡需要通过局部治疗、日常护理等方式来治疗。
怀孕期间有口腔溃疡需要进行局部的治疗，同时需要在口腔科或者妇科专家的帮助下进行局部的用药，避免自行服用，导致自身和胎儿都出现异常。可以用生理盐水，不会造成任何的伤害，可以用来漱口，可以购买0.9%的生理盐水涂抹在口腔的创面，也可以用95%的乙醇来治疗，不过要在医师的指导下进行。
