先天性缺牙的原因有可能是遗传性的因素所导致和环境因素都有关系的，胚胎期牙板发育受到物理障碍或者牙板断裂。空间受限，产生压力，使牙胚得不到最低限度的营养而退化，特别是第三磨牙。造成上皮组织功能缺陷或其下方的间充质诱导失败。
先天缺牙的治疗原则是恢复咀嚼功能，保持良好的(牙合)关系，缺牙数目较少的时候，对咀嚼功能、牙列形态和美观影响不大，可以不做处理，缺牙数目较多的时候，可以做活动义齿修复，恢复咀嚼功能，促进颌面骨骼和肌肉的发育。但是修复体必须随着儿童颌骨的生长发育不断更换，一般每年更换一次，以免妨碍患儿颌骨的发育。
缺牙数目较少时对咀嚼功能、牙列形态和美观影响不大，可以不做处理，多数牙先天缺失不仅影响咀嚼功能，而且影响患者的容貌，给患者生理和心理造成损害。因而缺牙数目较多时，可做活动义齿修复。
常用的义齿修复类型有种植义齿修复，可摘义齿修复和固定桥修复，种植义齿修复是目前最理想的义齿修复方式其恢复咬合功能理想美观并且不损伤邻牙。去正规的医院口腔科选择种植义齿修复，平时养成良好的口腔卫生习惯，按时刷牙，不吃甜食。
缺牙不补会导致牙龈萎缩，造成不可逆的影响。如果缺牙部位是游离端也就是位于最内侧末端的牙齿，拔除后即使不修复也不会有太大的影响。拔牙位置位于两个牙之间，长时间不修复拔牙的牙齿，有可能会造成两侧牙齿慢慢的向拔牙侧移动，出现拔牙的窝位置变小，牙龈萎缩，其他牙齿出现缝隙的现象，这是一种慢性的移动而且是长期导致的结果。建议患者在三个月或半年之后，进行牙齿的修复以防止其他牙齿的移动，而影响美观出现牙齿缝隙的现象。
缺牙不补根据牙齿的位置后果也略不相同。个别牙齿缺失或牙列缺失后，咀嚼效率随之降低或丧失，唾液分泌减少，胃肠蠕动减慢。如果缺牙部位是游离端也就是位于最内侧末端的牙齿，拔除后即使不修复也不会有太大的影响。缺牙位置位于两个牙之间，长时间不修复缺牙的牙齿，有可能会造成两侧牙齿慢慢的向拔牙侧移动，出现缺牙的窝位置变小，其他牙齿出现缝隙的现象，这是一种慢性的移动而且是长期导致的结果。建议尽早到牙科进行检查补牙，日常生活中注意口腔卫生，不要咀嚼太过坚硬或者黏性大的食物，中老年人尤其要注意。