宝宝消化不良可以吃益生菌。益生菌能够增加肠道菌群促进身体的消化吸收，对于治疗胃肠疾病有良好的作用，宝宝出现消化不良可能是奶粉喂养导致肠道没有适应。可以给宝宝吃一些益生菌。
通常情况下，益生菌治消化不良。具体情况分析如下：
乳酸菌素片、双歧杆菌三联活菌胶囊等是临床上比较常见的益生菌，乳酸菌、长型双歧杆菌、保加利亚乳杆菌等都具有调节肠道菌群的作用，具有抑制和杀死有害菌的作用，还能促进肠道蠕动，帮助食物消化吸收，改善消化不良、腹胀腹痛、肠鸣呕吐、食欲不振等不良反应。由于益生菌是活的，要用40℃以下的水冲服，否则会影响到它的活性。
宝宝消化不良，可以吃熟的苹果，但是不建议吃生苹果。
熟苹果的营养成分比较容易被消化和吸收，不会增加孩子的肠胃负担。另外，熟苹果中含有果胶，可以促进宝宝消化道中的菌群的生长，从而促进宝宝消化道的正常运转。
如果宝宝消化不良比较严重，还可以通过服用益生菌类的药物来调节宝宝的肠道菌群，以清淡、容易消化的食物为主。
一般情况下，治疗消化不良、腹痛腹泻、肠胃炎、肠粘膜破损等疾病的治疗有双歧三联活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌胶囊等。
这类药物通常包含的保加利亚双歧杆菌、嗜血链球菌、枯草杆菌、屎肠球菌等多种有益菌，具有一定的抑菌活性。但是患者还是需要在医生的指导下服用药物，不能自行决定用药，以免导致用药不当，影响患者的病情恢复。
消化不良宝宝应避免进食，可以服用药物改善症状。
孩子的消化不良主要是因为饮食方面的原因，如：暴饮暴食、胡乱喂孩子等，容易造成孩子的消化系统出现问题，增加胃肠的负荷，从而影响到孩子的消化。如果出现了这个症状，可以口服妈咪爱或小儿消积冲剂，这样有助于宝宝的消化功能恢复，同时还可以多吃含有丰富的维生素，例如果汁等。