如果喝清洁肠道的药物，而又没有形成腹泻，也没有达到肠道清洁的目的，就要找医生进行进一步的深入追寻。有一些病人是肠道梗阻，不可能出现肠道清洁，不能进行肠镜检查。如果没有肠道梗阻的存在，也没有明确的肠道排气、排便障碍的情况下，而出现肠道气积，说明肠道的功能有问题。
做肠镜前清肠子方法有：口服泻药清肠是常见的手段，服药后要多喝水，如果最后排出的是清水样大便，没有粪渣就是比较好的清肠效果，没有便秘的病人检查前4到6小时开始服用泻药就可以。
做肠镜前一定要清空肠道，具体的方法是在检查前1天，进食含渣少、易消化的食物，比如面条、稀饭，不能进食含根茎多的食物，在检查前10小时，需要服用泻剂来清空肠道，这些药物均需要服用2次以上，2次间隔4小时左右，然后大量的喝水以促进大便的排出。当大便拉至清水样、无渣时，说明肠道准备充分了。
肠镜前的清肠，常用的是口服硫酸镁肠道准备法，检查前一天进流食，检查前三至四小时口服百分之二十五硫酸镁150--200毫升，接着口服5%葡萄糖盐水或者温开水1500毫升，两小时内服完，45分钟后产生腹泻，腹泻数次后排除粪水无粪查后，即可行肠镜检查。
喝药3~4个小时就开始腹泻，结肠镜检查前需要进行肠道清洁，可以口服复方聚电解质粉或甘露醇进行通便，服用复合聚电解质粉后会出现腹胀、腹泻等不良反应，服用甘露醇，会出现口干燥症。应该注意适当的饮用水。