自闭症的中医治疗方法主要分为内治法和外治法，内治法主要包括中药组方配伍制成汤剂、散剂、丸剂、膏剂等，按照一定的服用方法进行内服，从而达到治病、保健的作用；外治法内容丰富。
儿童自闭症主要特征是漠视情感、拒绝交流、语言发育迟滞、行为重复刻板以及活动兴趣范围的显著局限性。面对这样的儿童平时多陪伴，和说话和玩耍，多培养的兴趣爱好，避免情况加重。以正确的方式引导跟同龄儿童玩耍交友沟通，慢慢地也会得到改善。
轻微自闭症目前主要的治疗方法有：心理行为疗法，包括侧重点不同的各种行为学疗法、图片交换交流系统、地板时光、人际关系发展干预，以及丹佛早期模式等；药物治疗，部分精神药物可以改善自闭症的部分症状；传统中医治疗，通过推拿、针灸、中药等传统医学方法来治疗自闭症；其他非药物治疗方法，包括饮食治疗、音乐治疗、生物治疗、马术治疗。
自闭症的儿童最佳的治疗方法是训练干预方法。教育和训练对自闭真儿童是最有效、最主要的治疗方法。能促进语言发育，提高社会交往能力，掌握基本生活技能和学习技能。目前药物治疗尚无法改变孤独症的病程，仅仅可以改善患者的一些情绪和行为症状，如情绪不稳、注意缺陷和多动、冲动行为、攻击行为、自伤和自杀行为。
药物治疗加上心理辅助，改善小孩的语言障碍、社会交往障碍，促进小孩的语言发育，提高社会交往能力，掌握基本生活技能和学习技能；药物治疗，不作为主要治疗。很多自闭症小孩都会有轻微的忧郁，药物治疗主要是缓解小孩子的一些情绪和行为。
精神检查：根据不同年龄阶段儿童的心理、生理等特点，充分了解患儿的病史，需由医生充分观察孩子的行为、表现、互动交流时的反应，包括是否具有刻板行为、特别执拗的反应、语言交流方面的障碍等标志性症状。中西医结合：以中医理论为基础，结合现代方法，利用分子生物学和现代免疫学的先进技术，中西医结合对自闭症进行综合治疗，提高治疗效果，让自闭症儿童早日走出封闭的空间，回归社会。