宝宝半夜发烧39度应该及时遵医嘱使用口服布洛芬混悬液来治疗，要遵医嘱。
布洛芬混悬液的退热效果很好，一般在半小时之内会出现明显退热，但退热时间维持不稳定，大约4到6小时，但是该药用药间隔至少4到6小时，24小时运用最多不能超过四次，并且使用该退热药物的时候，一定及时给宝宝补水，避免造成脱水，另外要遵医嘱使用。
发烧39度要用退烧药物或者物理降温的方法来退烧，可以选用非甾体抗炎药进行退烧，使用冰敷的方法，冰敷在腋窝下和额前，使用酒精擦浴的方法，同样在额部和腋下以及大腿内侧进行退烧。
体温达到39摄氏度，属于比较高的体温，问题比较严重。要积极检查，明确发烧原因，针对不同病因，给予不同治疗。与检查病因同样重要的还有退热治疗，临床工作中对于高于38摄氏度的体温给予退热药物治疗。
我们可以通过两种必要途径来进行退烧。一方面可以通过肌肉注射退烧药，来进行退烧，可以肌肉注射氨基比林，以及林可霉素和地塞米松，可以使患者的体温尽快的降下来。另一方面可以通过用20%的安乃近溶液滴鼻，也可以使体温尽快退下来，使体温恢复正常。
发烧在38度以上，属于高温，体温在40度以上，是非常危险的，可能出现一些不可逆转的后遗症或者是出现惊厥、休克、脱水、酸碱平衡失衡之后出现酸碱中毒的现象都有可能，尤其对于孩子体温中枢发育的不够完善，此时可能会出现惊厥的现象。
发烧39度可以用热毛巾热敷额头，不断的擦拭额头。可以用热毛巾擦拭腋窝、腹股沟等大动脉搏动的地方，也可以用酒精擦拭腋窝、腹股沟等大动脉搏动地方，因为酒精会很快蒸发，蒸发的同时会带走热量，可以使体温降下来。