矮小症诊断有诊断标准，参考的主要是2006年WHO的标准，具体如下：
身高低于同年龄、同性别儿童第三百分位以下或两个标准差以下，每年生长速度低于5cm-7cm，可以诊断为矮小症。诊断为矮小症后要做骨龄检测，看骨龄是超前还是落后。要做生长激素激发试验，检查性激素、甲状腺功能、染色体和基因检测、头颅和垂体磁共振等项目。目的是明确病因，排除特殊疾病，为孩子治疗做准备。
矮小症一般都是身体矮小，主要是孩子身高在同龄同性别的孩子之间较矮。儿童身高低于同性、同龄、同种族儿童平均身高的2个标准差，或者每年生长速度低于5厘米。矮小症的病因主要有营养性疾病、全身性及各种慢性疾病，如生长激素缺乏症、甲状腺功能低下等。要根据具体的病因，在医生的指导下进行对症治疗。建议家长及时带儿童到医院进行治疗。
小孩矮小症的判定方式如下：
孩子比正常同龄、同性别孩子矮半个头，或孩子衣裤2年不更换依然合适，身高检测一年身高的增长小于5cm，孩子可能有矮小症。诊断矮小症测一下孩子的身高即可。孩子身高低于同年龄、同性别、同地区正常孩子两个标准差以上，或者低300分位以下就是矮小症。确诊矮小症后要进行矮小筛查，根据病因对症治疗，让孩子身高达到满意水平。
儿童矮小症的判断标准是如果在相似环境下，同种族、同性别、同年龄人身高低于正常人群平均身高两个标准差以上或第三百分位以下，就能诊断为矮小症了。还有就是孩子身高增长速度也可以作为一个评判标准，3岁以下婴幼儿增长速度小于7厘米/年，3岁～青春期前，增长速度小于3～5厘米/年，青春期增长速度小于5～6厘米/年，都属于身高增长缓慢。
矮小症的标准如下：
矮小症是由于先天或后天原因导致骨龄与实际发育程度不一致而引起的一种疾病，标准是处于类似环境中的同一种族和性别、年龄相同的人，其身高比正常人的平均身高低2个标准差，甚至更低到第3百分位，三岁以下婴幼儿的增长速度低于每年7厘米；3岁-青春期前生长速度小于3-5厘米/年；青春期后的发育速度与成年时相当。青少年生长速度低于5-6厘米/年，均属是矮小症的一种。
判断身材矮小与否目前临床普遍采用标准差法对身材矮小进行判定，也就是孩子的身高比年龄，性别，区域都低、同一种族的正常孩子的身高标准小于2个标准差，从而确诊矮小症的发生。
有不少人认为自己孩子矮了，其实这是一种误解，因为每个人都会产生这种感觉，只不过程度不同而已。如儿童在相当长的时间内，比同龄人少了半个脑袋、并且每年长高不到125px，则可能疑似生长发育迟缓。生长速度变慢，常常是儿童疾病发生的一个早期标志。