拉肚子肛门疼可以采取以下几种治疗方式：
1.饮食不当以及腹部着凉等原因造成消化系统感染,是导致拉肚子的主要原因。患者可以通过口服肠炎宁进行接受治疗。
2.针对肛门疼痛的现象应该予以积极的治疗,可以使用温水进行坐浴,也可以通过高锰酸钾洗剂对肛门进行清洗。
3.治疗腹泻，如口服氧氟沙星胶囊。
在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
可能是便秘的原因或者是上火的原因造成的，可以用花椒熬水熏洗肛门，有消炎止疼的效果，注意饮食调理，不能吃辛辣刺激性食物，容易加重疼痛，多吃新鲜蔬菜和水果补充维生素。
肠癌肛门会疼，肠癌最常见的是直肠癌会有肛门疼痛，坠胀感，通过纤维结肠镜检查，可以明确病变部位，应早期手术治疗，术后根据病理分期进行静脉化疗，注意休息，积极治疗。
一般情况下，拉肚子、肛门疼，这是因为对因的作用，可以减轻拉肚子的次数，只要不经常刺激菊花，就不会出现疼痛。大便中有粘液，可以服用葛根清肠胶囊、黄连素片等药物。若为水状，可选用三联活菌片和蒙脱石散等益生菌。若肛周肌肤泛红，可用鱼肝油敷于该部位。大便没有异常，伴有肛门疼痛，建议到医院做一下检查，看看有没有肛裂，需要外用药治疗。
孕妇肛门疼可能是怀孕后引发的痔疮。
孕期由于肝火旺盛，胃肠消化功能紊乱，会出现便秘现象，导致肛门疼的症状。可以进行局部热敷，配合涂抹一些痔疮膏。如应用太宁膏涂抹肛门创面，可以起到抗炎消肿的作用。如果大便次数多，腹泻，容易导致肛腺感染，感染以后沿着肛管向肛周皮肤蔓延，容易形成肛周脓肿，可以行肛周彩超，明确诊断。同时注意保持局部的卫生清洁，适当喝蜂蜜水，适当户外运动，增加胃肠蠕动，防止发生便秘情况。
一般情况下，拉肚子的时候会有肛门疼痛的表现，因为大便时会有很多的肠道液排出来，这种物质会刺激到肠道的粘膜，从而引起肛门部位的疼痛。
如果有拉肚子的症状，可以服用蒙脱石散等药物进行支持治疗。需要到专业的医院进行详细的检查，确定引起拉稀的原因，如果还伴有便血的情况，也可能出现肛门疼，可能是肛裂的表现，患者可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如乳果糖口服溶液、润肠胶囊、麻仁软胶囊等。