手指指甲的霉菌感染，目前主要的治疗方式是局部治疗。效果比较明显的是阿莫罗芬搽剂，涂抹前要先将病灶的指甲刮得很薄，涂抹时要注意对周围的肌肤进行保护。如果外用药物没有明显的作用，可以服用特比萘芬，伊曲康唑，氟康唑等抗真菌药物。指甲上的霉菌是一种很难治愈的疾病，需要长期的治疗。另外也要注意自己的身体和公众的健康，尽量不要去碰指甲。
指甲真菌感染大多不能自愈，患者应积极治疗。
皮肤癣菌侵犯甲板及甲下所引起甲病变，俗称“灰指甲”。甲癣的病程缓慢，如果不进行治疗，可终身不愈，所以患者大多不能自愈。建议患者在医生的指导下使用阿莫罗芬、环吡酮胺、特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑等抗真菌药物进行治疗，能够有效改善病情。
指甲真菌感染可内服药物，单纯服用抗真菌药物，如灰黄霉素、氟康唑、斯皮仁诺等药物均有一定疗效，并且方便，但因为这类药物必须达到真菌所寄生的甲板处，才能发挥抗菌作用。患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
采用外用疗法治疗手指甲真菌感染，根据药剂的不同，分为浸泡，局部涂抹，封包削治。治疗时需配合去除病甲，故一般没有内服法方便，但却安全、无痛苦、无副作用。使用药的时候不要吃辛辣与刺激的食物。
甲真菌感染一般要做真菌显微镜检查、真菌培养、病理检查等项目检查。具体内容如下：
1.真菌显微镜检查：将病变部位的指甲刮取，并在显微镜下进行真菌学观察。如果甲屑检查多次为阴性，可以剪去病甲，用20%的KOH浸泡，在室温下溶解15-20分钟，将甲片软化，然后粉碎，观察甲板上的菌丝孢子。通常，镜检仅能鉴别真菌感染，但无法鉴别细菌，常见的是条状菌丝和节肢孢子；假菌丝体为簇生的孢子；短帚霉为群生的大孢子；如果是曲菌感染，表面的白色甲霉。
2.真菌培养：真菌培养可以鉴定特定的病原菌，但由于真菌的生长速度一般较慢，因此需要更多的时间。
3.病理检查：对于有高度怀疑的病例，可用于病理学检查和细菌培养为阴性的病例。除了有助于诊断，还有助于真菌的分类。病理学检查中有菌丝、芽孢等，是诊断甲癣的金标准，应在病理检查中进行真菌培养。
一般指甲出现真菌感染，可见于灰指甲。可以使用灰指甲的药物治疗。也可以到正规医院皮肤科就诊，在医生指导下进行治疗。另外注意是否有脚气，如果有脚气也需要同时治疗。平时还要注意衣服鞋袜的卫生，防止出现影响。注意不要接触猫狗等动物。