大部分的医院会采用激光或者冷冻的方法来治疗跖疣。这种方法属于物理治疗，见效快，但是比较容易复发。用切除的或者腐蚀的方法对跖疣的角质皮层去除，属于物理治疗，容易复发。跖疣是由人体病毒感染引起的，不建议使用创伤性的治疗方法。
需要去治疗和注意一些生活细节，疣可以传染给他人，尽量与其他人分开用洗浴用品，洗脚盆之类的东西。通常比如说用电子激光来进行治疗，也可以用冷冻的方法来进行治疗，严重的话要采用全身化疗或放疗的方式来进行治疗。
跖疣多是由人类乳头瘤病毒感染引起的，可以通过皮肤的微小破损自身接种传染。并且会传染得越来越多，越来越严重，有的跖疣是寻常疣在足底挤压形成损害，是病毒感染造成皮肤赘生物，免疫力下降，会有播撒，自愈的可能非常非常低的。发现跖疣就要尽早地治疗。
脚底长跖疣可以选择使用一些冷冻或者是激光的方式去除掉，有必要可以选择使用外用的抗菌软膏进行涂抹，连续外用两个月，目的是为了防止这种疾病复发，同时有必要可以选择光动力等方式进行治疗。治疗疗效相对来说会不错的。
跖疣的治疗可以通过局部手术来完成，而对于较小的状态可以使用局部激光或微波来去除疣。经过激光或冷冻或微波治疗后，局部皮肤会出现坏死和感染的可能性。要及时用碘伏进行局部消毒，防止感染。