月经老是不干净，呈咖啡色可以通过一般治疗、使用药物等方法进行治疗。
1.一般治疗：如果是腹部受凉导致的，建议注意一般治疗，即适当休息，适当使用温毛巾热敷腹部，有助于缓解症状。
2.使用药物：如果是宫颈炎导致的，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有头孢克肟胶囊、氨苄西林丙磺舒胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等。
一般情况下，月经呈咖啡色量少需根据实际情况来判断，具体内容如下：
女性每月经血的数量一般在30-80ml之间，女性经期的颜色为棕色，女性来潮的量不多，在此期间有性行为，可能是怀孕的表现，不一定是因为女性生理期的饮食或者是内分泌方面的问题。腹痛也有一种是与妇科炎症有关的症状，一般不会在妊娠期间，需要结合一些活血化瘀的药物进行调理，例如口服益母草颗粒或者是喝一些红糖水。
月经期间，如果出现咖啡色的月经，可能是妇科的炎症性疾病导致的，会对月经有一些影响。当患有阴道炎、子宫内膜炎、子宫颈炎等妇科炎症时，可能会出现月经颜色改变的情况，患者要注意观察自己的症状，看是否有痛经、阴道异常分泌物增多以及月经功能失调等情况，如果有，应及时就诊。患者也需要定期去医院做妇科检查，排除其它器质性病变。
一般情况下，如果来月经的第一天或月经即将结束时经血呈咖啡色，并且没有其他不适症状，一般是正常的生理鲜血，因为这种情况下，经血量较少，容易呈咖啡色。如果整个月经期间经血都呈咖啡色，则一般不正常，可能是腹部受凉、妇科疾病等原因导致的，女性需要做好腹部保暖，可以通过热水袋、热毛巾等物品来热敷腹部，同时，女性可以到医院进行相关检查，以明确病因，并进行针对性治疗。
对于月经第一天颜色呈深咖啡色是不正常的，正常的经血颜色为暗红色，刚开始量少，呈淡红色，然后逐渐加深。第一天颜色呈深咖啡色，考虑是有少量的出血，同时和腹部受凉、寒凝血瘀或肝气郁滞、气血不通有一定关系，可以适当地喝点红糖水，注意腹部的保暖。同时需要注意观察，有血块腹痛等，可适当地口服药物颗粒。
一般来说，月经第一天颜色咖啡色可能是正常现象、子宫脱落不良等因素导致的。具体分析如下：
通常月经第一天经血量都会比较少，而且颜色较暗呈咖啡色，如果没有其他不适症状，一般属于正常现象，无需过于担心。月经第一天颜色咖啡色也可能是子宫脱落不良导致的，患者可以遵医嘱使用益母草颗粒、温经汤等药物进行治疗，使月经更加通畅。女性在月经期间机体抵抗力下降，应注意保暖，避免着凉，以免引发感冒或其它疾病，如有身体不适症状，建议及时就医。