腱绡囊肿没有什么明显的症状，不用特色治疗，大多数可以保守治疗，用手指挤破囊肿，但是这样的话也有很高的复发几率，也可以穿刺把里面的液体抽取出来，然后注射激素类的药物。减少活动多休息，使用热敷。但是如果肿物持续增大，出现疼痛，影响活动的话，需要手术切除，这样一般不会复发的。
腱鞘囊肿最好发于手背、脚背以及肌腱腱鞘的表面。腱鞘囊肿的治疗要看有没有症状，如果没有症状，不影响生活和功能，可以不进行特别的治疗。腱鞘囊肿也不会长得太大，有时会自行消失。如果有疼痛或者影响穿鞋，日常生活的使用，则可以采用手段来消除腱鞘囊肿。在囊肿比较坚硬的时候，用手指挤破是最有效的方法，也是最快的办法。
随访观察：小囊肿可观察，无需处理，定期复查即可；B超下穿刺吸液：在超声引导下穿刺吸液，有一定的效果，但此方法易复发，且再次手术时可能发生粘连；腹腔镜肾囊肿去顶术：为常用方法，把整个囊肿的囊皮去掉，复发率低。
巧克力囊肿的治疗原则是：对有生育要求的年轻妇女采用药物治疗并定期随访检查。若症状较重，经药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术，如卵巢内膜囊肿巧克力液抽吸术，内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术，以保留正常卵巢和生育功能。不过经保守性手术后仍有复发。
肝囊肿药物治疗、手术治疗最好，具体分析如下：
1.药物治疗：肝囊肿的药物治疗主要针对囊型肝包虫病而言，是作为手术以外的一种辅助治疗手段。常用的抗包虫药主要包括甲苯咪唑、阿苯达唑、苯并咪唑等。药物治疗一般用于手术或介入治疗前后的辅助治疗，或者用于全身状况较差无法耐受手术或介入治疗的患者。
2.手术治疗：常见的手术有囊肿开窗术、肝部分切除术、囊型肝包虫病外囊完整剥除术等。
无症状的肾囊肿一般不需要治疗。若囊肿大于5cm且有压迫症状了，建议早期手术治疗(囊肿去顶减压术)是最好的治疗方法。手术治疗通常采用囊肿去顶减压术。此手术减轻了囊肿对肾实质的压迫，保护了大多数剩余的肾单位免遭挤压和进一步损害，使肾缺血状况有所改善，部分肾功能单位得到恢复，延缓了疾病的发展。手术成功的关键是尽可能早施行手术，囊肿减压必须彻底，不放弃小囊肿和深层囊肿的减压。
