对于乙肝小三阳的治疗，最主要的治疗是抗病毒治疗。当然，需要有抗病毒治疗的指征，如果肝功能是正常的，这个是乙肝携带者，没有抗病毒指征，定期复查就可以。如果转氨酶偏高，大于正常值上限的两倍以上，乙肝DNA也是阳性，就有抗病毒治疗指征。
乙肝小三阳一般会出现消化道的症状，会出现厌油，厌食，同时还会出现有乏力，黄疸，发热等表现，一般是由乙肝病毒感染引起来的一种肝部疾病。一定要做到讲究卫生，要杜绝病从口入，勤洗手。并且要勤锻炼，增加身体抗体，提高抵抗力。
可以选用中医为主治疗，中药调免疫、抗病毒、防纤维化效果持久且不易反弹。也可以去医院进行相关检查治疗。平时注意休息，预防感冒，在饮食习惯上应该避免辛辣刺激性食物，应该清淡饮食，合理搭配均衡营养，不要吃过与油腻的食物，凉东西。可以吃一些水果蔬菜，平时多喝水，不要喝浓茶咖啡。平时注意保暖。可以适当运动，增强体质。
定时注射乙肝疫苗。注射乙肝疫苗并不会马上就产生抗体，它大概要半年的时间，才会产生抗体。要让自己的身体里面有抗体，有抗体才会抵抗病毒，所以注射疫苗很重要，平时饮食清淡，注意休息。
要看具体是什么结果。如果是轻度的脂肪肝，肝功能正常。那么平时注意饮食，适当的锻炼就可以了。适当的低脂，高蛋白，高维生素饮食。不要喝酒。也就可以了。如果严重的脂肪肝，肝功能异常，可以考虑用药物，要多复查肝功能，有异常及时咨询医生。
大三阳转为小三阳，有可能是好的征象，也有可能是病情恶化的表现，还需要按照具体原因，转氨酶以及乙肝病毒来判断，若是病人感染乙肝病毒以后产生抵抗力将病毒清除，或者经过抗病毒治疗以后，产生抗体的同时，乙肝病毒转阴，这是好的现象，若是由于乙肝病毒前发生变异，抗原无法表达，只是显示抗体阳性，而乙肝病毒仍是持续高表达，转氨酶明显升高，这种症状下比普通的大三阳危害还要大，更容易出现肝硬化和肝癌。