治疗小三阳一般是要通过口服抗病毒的药物，一般可以达到完全清除的目的。同时还要注意饮食，以免加重肝脏的负担，减少肝脏的抵抗力，同时还要多吃维生素含量比较高的食品，提高人体的免疫力。
小三阳病人首先应检测肝功能，化验血中HBV-DNA含量及前C基因变异情况，并通过必要的肝活检来正确分析这种小三阳是否需要采取治疗措施。如果肝功能正常，HBV-DNA阴性，不需要治疗，半年定期复查。如果肝功能异常，HBV-DNA阳性，则需要治疗。
乙肝小三阳失眠要从生活方式和药物治疗两个方面考虑调整。
乙肝小三阳患者晚上不要吃太多，以防出现消化不良、腹胀等症状，影响睡眠。晚上不要从事导致神经过度兴奋的行为，让睡眠环境安静下来。如果经过一段时间的自我调整后仍然失眠，可以去神经内科，用一些促进睡眠的药物。但要告知医生自己得了乙肝，要使用对肝脏损害不大的药物进行调整。
可以做肝功能和肝B超检查，如果都正常，则不用治疗，定期每半年做肝功能和肝B超检查就可以了，如果肝功能不正常，特别是转氨酶高，就需要治疗。小三阳只要定期检查，肝功能正常，病毒无复制就没问题。
小三阳在肝功能正常的情况下，一般不需要治疗。但是在乙肝病毒DNA高于2000，谷丙转氨酶超过正常值上限，或者转氨酶虽然正常，但有肝硬化的情况下。对于年龄超过30岁，病毒量很高，虽然没有肝硬化，但家族中有肝硬化和肝癌的，也可以考虑治疗。
乙肝小三阳是否需要治疗，患者需根据具体的情况来判断。
对于乙肝小三阳，只要肝脏和dna都没有问题，患者通常为健康携带者，只要按时随访，不用吃药，如果是HBV、DNA、肝脏等指标都比较高，就要进行相应的检查。肝功能转氨酶超过2倍，同时乙肝DNA超过10，则要进行抗菌和护肝治疗，同时还要定期进行肝功能检查和DNA检测。