治疗小三阳一般是要通过口服抗病毒的药物，一般可以达到完全清除的目的。同时还要注意饮食，以免加重肝脏的负担，减少肝脏的抵抗力，同时还要多吃维生素含量比较高的食品，提高人体的免疫力。
目前临床上，乙肝小三阳绝大部分是肝功能持续保持正常、无任何临床症状的乙肝病毒携带者，可能暂不需要治疗，饮食方面要清淡，避免各种刺激性，辛辣食物摄入，忌烟酒。多注意休息，定期复查。
肝硬化是慢性肝病恶化的体现。肝硬化如果不积极治疗，大部分会发展为肝腹水甚至肝癌。所以肝硬化要积极治疗。在治疗的时候一定要选择适合有效方法，避免治疗误区。只有长久抑制或者清除乙肝体内病毒，乙肝病毒才能长久稳定。
治疗小三阳的最佳方法要分情况，如果小三阳的时候乙肝病毒并没有对肝脏或者身体的其他部位造成伤害，可以不服用任何药物，但是需要注意不能饮酒，不能使用明显损伤肝脏的药物，还应该定期的进行复查，复查是为了及时发现肝功能的异常。
小三阳是不容易转阴的，不是打几针就能使其转阴的。无论是“大三阳”还是“小三阳”，如果肝功能正常，又没有明显的现象，都称为乙肝这种肝病病毒携带者，这种不用治疗，半年或一年查一下肝功、B超。平时注意饮食少饮酒、保持良好心态。平时一定要注意不要过于劳累，禁酒，不要吃肝损害的药物。多喝水多吃蔬菜水果。
乙肝小三阳转氨酶升高是需要加强一些保肝降酶的治疗并同时要检查乙肝DNA，腹部彩超，甲胎蛋白，血常规等指标，如果病毒量高，腹部彩超提示有肝硬化，就需要进行规范的抗乙肝病毒等综合治疗，如果病毒量低，或者病毒是阴性的，暂时不需要抗病毒治疗，加强一些保肝降酶的治疗就可以，需要充分的休息，绝对不能喝酒，一定要做到定期的复查。