腰穿一般没什么后遗症，腰椎穿刺的术后并发症主要是低颅压性头痛，表现为坐起后有明显头痛，而平卧后头痛减轻或消失，这主要是由于部分患者手术后，仍有部分脑脊液从穿刺针口中外漏，造成颅内压力降低，牵拉神经，导致头痛，所以在做完腰椎穿刺术后，一般都嘱托患者卧床4到6小时，以预防低颅压性头痛的发生，此外即便发生了低颅压性头痛，一般持续4到6天后常可自愈。
腰椎穿刺可以检查以下病：
脑膜炎、蛛网膜下腔出血，脑肿瘤等颅脑疾病，血液系统疾病、脊柱结核，脊柱肿瘤等，都可以通过腰椎穿刺检查出来。腰4和5节段是腰椎穿刺的首选位置。在手术的时候要进行无菌性操作，每一次都要有足够的脑脊液，如果排出太多脑脊液，可能会造成颅内压力过高，使患者出现头疼的症状，可以通过脑脊液的病理学检查来诊断以上疾病。
腰穿可以检查脑部疾病的，腰穿术后需要去枕平卧四小时至六小时，视患儿情况而定，对惯于用枕者，在其头后放一薄枕三厘米至五厘米厚，使颈部肌肉松弛，腰背处也垫一薄枕，以防止穿刺后腰背不适。腰穿以后还需要动态监测体温、脉搏、呼吸、血压、意识、瞳孔、呕吐、头痛等情况，发现异常及时报告医生，以免发生意外。
腰椎穿刺后患者去枕平卧6小时左右。
通常来说，做完腰椎穿刺手术，病人要平卧6个多小时，有些地方是要求病人平卧4个多小时。腰椎间盘突出症患者在做完手术后，最好在卧床上躺6个小时，然后起床进行小便等必要活动。但是最好要多休息，避免出现低颅压。尤其是不能做激烈的运动，比如跑步和跳跃。
日常生活中，患者要做好腰部保暖工作，不要受寒，多吃新鲜的蔬菜水果。
患者侧卧位，腰背部消毒、铺无菌巾。向腰后部正中定好的腰椎间隙打局麻药。使用腰椎穿刺针从腰后部正中向前方慢慢刺入，经过腰后部的韧带进入椎管内。使用注射器抽取少量的脑脊液进行化验。如果需要药物治疗的情况下，再向穿刺针内打入药物。操作完毕后，撤出腰穿针，局部用棉球压迫。
腰椎穿刺术后通常需要平卧4-6小时。
腰椎穿刺是一种常见的手术方法，在临床上被广泛应用。在进行腰椎穿刺手术时，首先要将穿刺针插入到蛛网膜下，然后从皮下穿出，经过深筋膜层，进入棘突窝，黄韧带，然后通过硬膜，通过蜘蛛网膜，最终到达蜘蛛膜下。腰椎穿刺可能会引起低颅压征、椎管内出血、神经损害、损伤、感染等并发症，临床上比较常见的是低颅压，会导致头痛、恶心、呕吐等症状。