在急性发作期的肾长结石就会出现肾脏绞痛，或者出现小腹部疼痛，临床上即使不排出体外，一般会持续24小时到48小时左右，但是肾结石在排出体外的时候，适当应用一些止痛药物或者消炎药疼痛就可缓解，平时要注意休息，不要多走动。
肾结石疼痛的部位如下，通常在后腰部或者是腹部，疼痛表现比较明显，有的感觉是腰部的酸胀或者不适，严重的时候，结石排出的过程中嵌顿在一个部位，会出现后腰部有刀绞一样的疼痛称之为肾绞痛，常常突然发作，排尿的过程中因为嵌顿然后导致突然发作，疼痛可以向下腹部或者腹股沟，还有大腿的内侧放射。女性可以放射到阴唇的部位。
肾结石发作通常会持续特疼痛。
肾结石通常会在肾和输尿管中来回走动，在运动的时候会引起肾区和输尿管的持续性的痉挛，从而造成持续的疼痛，这种疼痛还会加剧，可能出现恶心、呕吐、血尿等症状。在疼痛发作期间，可以使用双氯灭痛栓或消炎痛栓，这样可以迅速的减轻疼痛。当疼痛缓解后，要马上做肾、输尿管、膀胱彩超，检查结石的位置、大小、是否有肾积水、尿常规等。结石的体积越小，疼痛越频繁，疼痛越重。
肾结石疼痛在医学上被分为是11级疼痛，它是内脏疼痛。医学上最严重的疼痛分级是12级，就是母亲的分娩痛。内脏疼痛仅次于分娩痛。肾结石的疼痛一般都是因为结石排泄过程中导致输尿管痉挛，肾脏积水，疼痛呈阵发性绞痛，疼痛向下腹部膀胱区及后腰部放散，同时有血尿，还伴有恶心呕吐胃内容物。患者因疼痛辗转反侧，痛不欲生。
肾结石主要是腰背部疼痛。结石的位置不一样，疼痛的性质也不一样。如果是肾盂内大的结石，或者肾盏的结石，一般没有明显的疼痛，也没有明显的临床症状，主要是活动后出现上腹部、腰部钝痛的表现。当肾脏小的结石由肾盂排到输尿管时，会引起肾绞痛或者输尿管绞痛的表现，最典型的表现是阵发性的腰部疼痛，或者上腹部疼痛，疼痛剧烈难忍，疼痛阵发性的加重，疼痛时可能会有恶心、呕吐、血尿等症状。
