阴茎上长痘痘可能是生殖器疱疹、尖锐湿疣等原因导致的，不同原因可采取不同的治疗方式。
1.生殖器疱疹：生殖器疱疹一般是由单纯疱疹病毒感染肛门生殖器皮肤黏膜所致慢性复发性的性传播疾病，患者的生殖器常会出现水疱、溃疡等情况，患者如果患上了此疾病，阴茎上不仅会长有痘痘，还可能会伴随出现瘙痒、烧灼感等不适。患者可以按照医嘱使用阿昔洛韦分散片、盐酸伐昔洛韦片、泛昔洛韦片等药物进行治疗。
2.尖锐湿疣：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的，以疣状增生为特点的性传播疾病，患者在患病初期生殖器周围通常长有单个或者多个散在的淡红色小丘疹，患者可能被人乳头瘤病毒感染，进而导致阴茎上长有淡红色小痘痘，还可能会伴随出现灼痛、刺痒等不适。患者可以按照医嘱使用咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶乳膏、鬼臼毒素软膏等药物进行治疗。
男人阴茎上长了小疙瘩，需要考虑生殖器疱疹的可能，由单纯疱疹病毒（HSV）感染所引起，其次需考虑梅毒、尖锐湿疣及肿瘤等疾病，可以考虑到医院做个抽血检查确诊，建议不要饮酒，多吃富含维生c、蛋白质丰富的食物，有助于疾病的康复，可以考虑采取服用抗病毒治疗。
阴茎上长了痘痘，如果痘痘伴有一定的疼痛或者是红肿的现象，可能是局部的毛囊炎，皮脂腺炎等引起的，这是因为有感染。如果痘痘没有任何的症状，而且质地比较坚硬，这可能是尖锐湿疣。也有可能是皮肤纤维瘤。
去泌尿科。主要就是注意保持个人卫生，经常的清洗，到医院进行检查，依据情况进行激光治疗。注意保持局部的干燥卫生，避免搔抓，以防止皮肤破损后继发细菌感染。禁止性生活。
阴茎上长了很多小痘痘是，有可能是皮疹。
皮疹初起时为针头大红色毛囊性丘疹,有痒感,周围有明显的炎性红晕,迅速变成粟粒大脓疱,中心有毛发贯穿,脓疱大多分批出现,不相融合,疱壁薄,脓疱破溃后有少量脓性分泌物,自觉瘙痒和轻度刺痛。数日后干枯,结成黄痂,痂脱即愈,不留疤痕,但易复发。男青年的阴部及其它长阴毛处均是好发部位。病程多慢性经过,性质顽固,迁延难愈。,用药的话可以买点红霉素软膏外用再口服消炎药!生活护理：平时多洗澡注意阴部卫生。
近期如果并未有不洁性生活史，通常是由于卫生未做好或是所穿的内裤质量并不是特别，受到病原菌感染，引起的毛囊炎，多数是受葡萄球菌，有时也可分离出表皮葡萄球菌侵袭。不清洁、搔抓及机体抵抗力低下容易发病。