肾积水较轻，病情进展缓慢，肾功能已达平衡和稳定状态可观察，但应定期检查了解积水进展情况。可自行解除的梗阻，如孕妇生理性肾积水。肾积水进行性加重，临床症状明显，肾功能不断下降，梗阻病因明确，有并发症存在，应手术治疗。
肾积水的治疗大多数人不用治疗，可完全治愈。而由泌尿系感染引起的肾盂积水，多建议应用抗生素治疗，建议行中段尿微生物培养、泌尿系彩超、泌尿系CT等相关检查，治疗疗程一般为2周，为复杂性尿路感染。待感染控制稳定以后，肾积水也可以自行消失。如为梗阻引起的肾积水，明确是结石还是肿瘤压迫引起的，大多数解除梗阻后，肾积水可以消失。
出现肾积水之后，应到做穿刺治疗，这样可以帮助更好的治疗，引发肾积水的期间，更应该注意做好消炎措施，这个期间还应该注意保持饮食的清淡，而且应该注意做好滋补养生的工作，这样可以防止造成病情加重，也可以防止造成其他影响。
去除肾积水的病因，保留患肾，如梗阻尚未引起严重的不可恢复的病变，在去除病因以后，往往会获得良好的效果。手术方法取决于病因的性质，例如先天性的肾盂输尿管连接部狭窄，可作肾盂成形术，肾、输尿管结石可行碎石或者取石术，这些手术近年来可用内腔镜，就是腹腔镜来进行，术后肾积水及肾功能就会有明显的改善。
拔罐不能治疗肾积水。出现肾积水时，可以选择用拔罐的方式进行改善，但并不建议患者私自的进行拔罐，如果乱拔罐很有可能会伤害到局部的皮肤引发其他的病症。建议患者应到当地医院进行肾功能检查，医生会根据肾积水的情况帮助患者使用药物或者是手术的方式进行治疗。治疗期间患者应注意饮食清淡，不吃辛辣刺激油腻的食物，多吃一些新鲜的瓜果蔬菜，同时不可乱用药物，不要相信所谓民间偏方。
如果肾积水合并严重感染，导致感染性休克，需及时抢救，感染性休克病死率高达50%。肾积水严重程度不同，对患者的寿命影响也不同，中重度肾积水，可能导致肾脏感染、肾脏积脓、肾功能减退，病情发展可导致肾功能不全，引发尿毒症等严重疾病，威胁患者生命单纯肾积水，对患者的寿命影响不大。