一般情况下，卵巢囊肿患者可以通过医学检查、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
如果是直径在5cm以下的卵巢囊肿，同时检查CA125、CA19-9、CEA、AFP等指标是否在正常范围内，可以在月经结束后进行妇科彩超检查。如果是一个直径超过5cm的卵巢囊肿，同时还要做妇科彩超检查。卵巢囊肿外科治疗通常是对有需要或尚未绝经的妇女，应行腹腔镜下摘除或剖腹切除。如果是绝经期后的妇女，或者是因为有恶性肿瘤的原因，需要进行手术治疗。
卵巢囊肿可以分为病理性的和生理性的，生理性的卵巢囊肿一般比较小，而且不会引起明显的身体不适，月经推迟不一定就是由卵巢囊肿引起的。当月经推迟时，有性生活的育龄期女性首先要排除是否存在已经怀孕的情况。如果可以排除怀孕，月经推迟7-10天一般是正常现象，如果月经推迟超过10天，可去医院做个妇科B超检查，排除病理性囊肿。
严重的卵巢囊肿建议尽快手术给与治疗，并且在月经干净三天到七天做手术，手术之前可以抽血检查妇科肿瘤三项来了解癌胚抗原癌肿抗原是否异常，患者可以选择腹腔镜手术，无论是哪种方式都建议在手术后将切除的肿瘤送病理给予化验。
如果是在手术过程中发现或者怀疑囊肿有恶性变，建议做病理切片给予诊断，再在以上的指导下决定手术范围。
一般情况下，女性卵巢囊肿处理方法，具体分析如下：
如果是单纯的囊肿，直径超过五厘米，建议进行外科治疗。一旦确诊为实心肿瘤，立即进行外科治疗，通常都是通过腹腔镜进行的，可以做腹腔镜下的囊肿摘除手术。
平时女性要注意保持良好的作息规律，多喝温开水，多吃新鲜的瓜果蔬菜，还要注意保暖、多休息，有助于身体健康。
2cm的卵巢囊肿一般不需要特别治疗，需要进行动态的检查，等下次来例假后做一次子宫附件彩超检查。如果检查子宫附件的时候，发现囊肿比以前更大，并且在5cm以上的时候，需要做外科手术。如果囊肿继续生长，并且生长速度较慢，肿块标记也是很好的，可以服用红金消结胶囊类的药物，服用两周左右，下一次来例假，以确定囊肿的状况。
通常情况下，良性卵巢囊肿可以通过手术来治疗。具体分析如下：
卵巢囊肿是卵巢常见的良性肿瘤，由于卵巢囊肿不会具有恶变的可能，因此，临床上对于没有临床症状卵巢囊肿可以不给予任何处理，单纯给予临床观察即可，常规进行超声检查，妇科检查和化验肿瘤标志物CA-125检查即可。但是，对于卵巢囊肿较大，伴有压迫、阻塞周围组织器官功能的，或者因为卵巢囊肿可能导致蒂扭转危险的患者，则建议手术治疗。