小孩扁桃体发炎可能是病毒、细菌等致病微生物引起的。
一般情况下，引起小孩扁桃体发炎的因素可能是病毒，如
鼻病毒、冠状病毒及腺病毒、副流感病毒、疱疹病毒、流感病毒、肠道病毒等。此外，小孩扁桃体发炎还可能是细菌引起的，通常有A组乙型溶血性链球菌、肺炎链球菌、流感杆菌等。此外，如果小孩受凉或者过度劳累，就可能会导致病毒、细菌等侵入机体，导致免疫力下降，不利于身体健康。
扁桃体发炎，引起咳嗽严重的需要输液消炎治疗，同时配合雾化吸入抗炎止咳，稀释痰液利于咳出。同时可以给孩子做雾化，雾化的话，止咳效果的效果比较好，但具体的用药还需要遵循医嘱。
小孩扁桃体炎咳嗽是由于扁桃体中的某些炎症渗出过多而引起的，此外，扁桃体炎、肺炎、支气管炎、肺炎等并发症时，咳嗽的可能性更大，要结合自身的情况，制定相应的治疗方案。急性扁桃体炎是由细菌感染引起的，常见的有链球菌、葡萄球菌、流感嗜血杆菌等，可以选择一些敏感的抗生素进行抗感染治疗，比如大环内酯类的抗生素、青霉素类的抗生素、头孢类的抗生素。
如果是在急性扁桃体炎的高烧期间，需要适当的减少吃鸡、鸭、鱼、肉、蛋等的蛋白质，因为蛋白质的摄取会引起人体的基本新陈代谢率产生热量，从而降低体温。不过，如果在康复期间，或没有出现明显的发烧，可以通过补充一些优质的蛋白质来增强机体的免疫力，例如：鸡、鸭、鱼、瘦肉、蛋、豆制品等蛋白质类的食品，并且要多吃一些新鲜的蔬菜和水果，补充维生素，还要多饮水。
儿童的扁桃体发炎，一般考虑都是细菌感染的，单纯性扁桃体炎比较常见，孩子除了咽痛，吞咽疼痛和困难之外，会伴随有不同程度的发烧，而且很多都是高热，一般治疗主要就是对症的使用头孢类的消炎药物。
小孩扁桃体发炎的症状有明显的咽痛症状，部分年龄较小，可能不会准确的表达咽痛的感受，表现为哭闹、烦躁、拒食等。如果病情程度较重的话，可能会有畏寒、发热、头痛等症状，甚至可能会因长时间不能正常的进食和进水，甚至可出现脱水的状态。在治疗上需要根据小孩的具体症状表现使用抗感染药物治疗的同时，适当的给予补液支持治疗。