牙齿矫正的坏处主要是有可能导致牙槽骨发生吸收，形成人为的牙周病，也可能会产正畸性牙龈炎或者是牙周炎，因为正畸需要移动牙齿及牙根，在移动过程中可能会使周围牙槽骨吸收。
牙齿矫正会出现酸痛、肿胀、出血或者是不适的现象，这种现象是因为牙髓受到了伤害而导致的，可能会导致牙齿出现损伤，明显的松动现象，感染、牙周炎、牙龈萎缩、牙根暴露等现象。卫生习惯不好，饭后不刷牙，牙齿上残留了食物残渣发酵后产生的酸，会对牙齿产生副作用，使牙齿变黄或者是有坑洼现象。
通常来说，儿童牙齿矫正方案有戴牙套、正颌手术等。
1.戴牙套：牙套在牙齿矫正中起着至关重要的作用，通常包括钢丝牙套、隐形牙套、陶瓷牙套、自锁牙套、硅胶牙套等，适用于儿童牙齿矫正。
2.正颌手术：如果是颌骨发育异常引起的，能够解决牙齿排列不整齐、牙齿龅牙、侧面下巴明显较长等问题，所以儿童的牙齿如果存在这些问题，可以通过正颌手术矫正。
牙齿矫正没有危害，牙齿矫正可以矫正牙齿的咬合关系，是面容变得更美丽，没有副作用，越早越受益，但是矫正过程中可能会出现疼痛，牙齿敏感等不适应状况，不要害怕，坚持配合治疗即可。
牙齿的矫正是没有副作用的，但是前提要去正规的医院。然后积极进行治疗，做的越早对牙齿的矫正帮助也就越大。在牙齿矫正过程中，可能会出现牙疼或者特别的敏感，这些都是正常的反应。在牙齿恢复期，要尽量避免辣食和凉食，这样不利于牙龈的恢复和生长。
牙齿矫正拔牙会出现拔牙的地方出血、肿胀疼痛，咀嚼障碍，感染等一系列口腔问题。1,拔牙后伤口长时间出血。牙医有各种处置手段来解决拔牙后伤口的出血问题，但是，必须指出的是，拔牙后在唾液中混合少量的血是正常现象，有时，这一现象甚至长达72小时。2，拔牙后肿胀。这往往是因为整个拔牙过程中，医生用去了太多的时间(如拔牙时伤害到了牙齿周围的软组织和骨头)。一般来说，当拔牙必须提升牙床时(骨膜覆盖骨会因此受伤)，就会引发轻微至中度肿胀。3·拔牙还有可能会引起牙槽骨出现萎缩的情况，吃东西时可能会出现咀嚼障碍；可能会有多种并发症的发生，例如干槽症、下颌关节损伤。4.拔牙后护理不当，还有可能会引发牙龈感染。建议在拔牙后做好口腔护理，拔牙后不吃辛辣刺激的食物。注意口腔卫生。按时服用医生开的止痛消炎药，在矫正过程中应该积极配合医生。矫正完以后要在医生的指导下仔细护理。如拔牙处有感染，及时到医院口腔科就诊。