种牙基本没有什么危害。目前种植技术是一项发展非常成熟的技术手段，相应的软硬件设施发展都非常完善，而种植材料本身也是与人体相容性非常优良的材料，所以术前准备充分，术中操作得当的前提下病人基本不会有明显痛苦。
影响人体免疫功能，人体的免疫系统会一直攻击这种入侵的“异物”，免疫系统负担就会比较重，造成牙根损伤，因为是种植在牙槽骨上面的，所以在种植牙后有可能会出现牙槽骨塌陷的情况，也有可能会受到细菌感染，导致牙周炎、牙龈炎发生。而且人体自身会对种植牙排异，牙龈会不断发生萎缩，到了一定的时间，种植牙就会脱落了。
镶牙种牙和植牙的区别是修牙方式不同上的区别。传统的镶牙方式还有一些缺点，如异物感非常强，以及咀嚼效能相对比较差。种植牙首先将人工牙根植入颌骨内，在其上部修复牙齿，种植牙是一种固定的修复方式，不存在摘戴的问题。
第一步植入种植钉与牙槽骨愈合，第二步等到种植牙与牙槽骨愈合之后再带上牙冠。术后短期不能使用种植牙齿咬合或者咀嚼食物。会对牙齿带来很大的磨损。在种植牙齿周围已经没有了感受器，这样会对牙根组织带来一定的损伤，稍微受到外力作用就可能会碎裂。
镶牙和种牙最大的区别在于假牙的根基是建立在自己的牙上还是人工牙根上。镶牙分为活动义齿和烤瓷牙，两者都是以自己的牙齿作为假牙存在并行使功能的基础。活动假牙有钩子挂在自己的牙上，以防止掉下来。烤瓷牙则是把自己的牙齿磨小后再套一个牙套，也就是以自己的牙为桥桩来造桥。种牙则和自己的其他牙齿无关，在缺牙处打个人工牙根作为地基和梁，然后以此为基础在上面造房子把牙齿恢复出来。
镶牙和种牙的区别是镶牙需要将缺牙位置的两边牙齿磨小以作为固定牙套的支撑，牙套在口腔内人们会感觉不舒服，而种植牙则是采用与人体相容性好的钛金属制作成一个圆柱体，再将牙冠安装在种植体上，不会损伤邻牙，更不会有异物感、不舒服感。