卵巢巧克力囊肿的症状主要有以下几点：房事疼痛，不正常的经痛，没有避孕也不会怀孕，明确病因，针对性治疗。卵巢巧克力囊肿在临床上多表现有小腹疼痛、小腹不适、白带增多、白带色黄、白带异味、月经失常、月经失常，而且通常小腹内有一个坚实而无痛的肿快，有时性交会发生疼痛。
无排卵月经失调，如闭经、功能性子宫出血、内分泌失调、月经稀发或不排卵月经，常伴有多毛、肥胖、不孕、双侧卵巢增长或单侧卵巢增大及一些激素水平的改变。进行性相关的检查，了解具体的病情，针对性的用药进行治疗。
症状主要表现为月经稀发、量少、闭经，或者是出现功能失调性子宫出血。当然也有一些会有闭经与月经过多交替出现的情况除了月经不调以外，还可以表现为多毛。肥胖等症状，治疗，主要是使用激素或者是配合。
巧克力卵巢囊肿一般指子宫内膜异位囊肿。通常情况下，子宫内膜异位囊肿目前为止病因还不清楚。子宫内膜异位囊肿是指卵巢内的异位子宫内膜组织周期性反复出血，形成被卵巢实质包裹的血肿，当具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢局部的时候，随着每次来月经异位症的病灶，在卵巢内也会出现出血的现象，患者可以通过囊肿剔除术、囊肿穿刺术、卵巢切除术等方式进行治疗。
部分巧克力卵巢囊肿是无症状的，只有在囊肿较大时会有下腹不适或者可自腹部摸到腹部包块，伴随扭转或者破裂时会有疼痛。大部分的巧克力卵巢囊肿都是去医院进行超声检查时发现。孕早期囊肿较大，注意休息，避免经常弯腰活动，以防囊肿扭转坏死，如囊肿增大经常伴有腹痛，需手术切除。去专科医院就诊。
通常情况下，巧克力卵巢囊肿是子宫内膜异位症。
是指子宫内膜与卵巢发生异位所引起的一种囊肿。子宫腔内的内膜剥脱后呈暗红色，像是巧克力，这种情况出现在卵巢上，称为巧克力状卵巢囊肿。巧克力卵巢囊肿属于双侧，女性在月经期间会有左右下腹疼痛，这是痛经的症状。如果卵巢巧克力囊肿比较小，疼痛比较轻微，可以通过适当的镇痛来减轻；如果是巧克力性卵巢囊肿比较大，可能会出现蒂扭转，但术后很可能会出现复发。