可以选取任脉和足太阴脾经的穴位，比如中极穴，可以通调冲任，理下焦之气；地机穴，能够行气活血止痛；三阴交穴，能够调理肝、脾、肾，活血止痛。还可以用次髎穴，是治疗痛经的经验穴位。
一般情况下，痛经艾灸以下位置：
痛经是妇科临床上比较常见的症状之一，女性出现痛经是由于女性的子宫内膜分泌的前列腺激素升高，或是由于自身存在的一些妇科问题所导致的。可以通过艾灸来进行治疗，可以选用子宫、涌泉、三阴、足三里、阴陵、神阙、关元等穴位进行艾灸，能够疏通经络，从而缓解痛经。同时做好保暖工作，尽量不要受凉。
一般来说，如果在来月经的时候进行艾灸，通常灸腹部远处的穴位最好，比如三阴交、阴陵穴、地机、漏谷等。三阴交一般位于内踝上三寸，胫骨前缘；地机穴和漏谷穴一般位于小腿内侧；阴陵穴一般位于膝盖之下，即胫骨内侧下缘和内侧缘之间的凹陷。如果在艾灸腹部的穴位，可能会导致月经量增加。如果是在非月经期进行艾灸，位置通常位于下腹部。
痛经是困扰了很多女性的疾病，按穴位确实有一定的效果，针刺三阴交、中极、归来、太冲、内关等穴位都是有效果的。另外可以配合口服一些痛经药物，还有效果的。如果还是疼，可以去正规医院检查，对症治疗。
通常情况下，痛经可以针灸三阴交、中极、足三里等穴位。具体情况分析如下：
痛经有实证，有虚证，腹痛多在经前或经期出现，疼痛剧烈，拒按，经色紫红或紫黑，有血块，血块下后疼痛缓解，为实证。针灸时可选取三阴交，中极，次髎；如果患者经前伴有乳房胀痛，舌质暗有瘀斑的属于气滞血瘀型，可在上述穴位基础上加太冲；腹痛有冷感，得温热疼痛缓解的患者为寒湿凝滞型，可加归来，地机。腹痛多在经后，小腹绵绵作痛，少腹柔软喜按，经色淡，量少，为虚证，治疗以调补气血，温养冲任为主，可取三阴交，足三里，血海；若患者伴有面色苍白，倦怠无力，头晕眼花，为气血不足型，可加脾俞，胃俞；伴有腰酸膝软，夜寐不宁，头晕耳鸣，舌红，少苔者，为肝肾不足型，可加太溪，肝俞，肾俞。