蛀牙几乎被蛀空只剩残根，总的治疗原则是镶牙前能保留的牙根应尽量保留，尤其是牙根健康状况比较好的，可以通过相应的治疗，保留残根。若是残根已经软化糜烂，牙龈红肿充血甚至化脓肿胀，就需要考虑拔除的。
龋病是一种常见的牙齿疾病，一般是由浅龋中龋、深龋3种，当牙齿仅剩下牙根时，就是严重龋。
患者可以到医院检查一下，如果牙根没有吸收，根尖一型，可以在进行完根充填后再进行烧瓷修复。若X光片提示病灶的病灶状况不佳，并有显著的吸收，应立即清除。拔掉残根通常是在不同的级别的医院进行的，在三甲以上的地方，大概要一百块钱。
建议拔除牙根进行义齿修复。考虑到烤瓷牙需要磨除邻牙会危害邻牙健康，活动义齿的压力会加速牙槽骨萎缩下降，而种植牙拥有独立牙根没有这两者的问题，并且牙根可以起到阻止牙槽骨萎缩的作用，所以种植牙修复缺失是不错的选择。
只剩下牙根需要拔除时，到正规医院的口腔科进行牙齿的拔除术。因为正规的医院器械的消毒会有保障，拔除之前拍摄此牙的根尖片或者曲面断层片，看看牙根的形状，走行的方向，有几个牙根，是否有牙根的畸形，以及与重要的解剖结构，如上颌窦、下牙槽神经管的关系。确定以后一般先用麻醉药麻醉，然后分离牙龈，用牙挺将要拔除的牙根挺松，再用牙钳或者牙挺将牙根取出。
牙齿蛀牙只剩下残根应考虑去医院口腔科进行拔除治疗，并进一步镶嵌义齿，以免影响临近健康牙齿。注意口腔卫生，餐后刷牙漱口，饮食宜清淡易消化富有营养，忌食硬食甜食及油腻辛辣刺激性食物，忌烟酒。