进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
肛肠检查有常见的有肛门视诊是肛肠检查的第一步。直肠指诊，可以触摸观察是否有直肠息肉、直肠腺瘤甚至一些位置比较低的直肠恶性肿瘤。还有置入肛门镜检查，肛门镜检查可以明确地观察直肠粘膜是否有感染，是否局部存在裂口。
肛肠科检查方式有很多种，可有肛门视诊，即用拇指轻轻分开病人的臀部，观察肛门及肛周有没有脱出物、外痔、外口、脓肿，也可以看到肛门周围有没有色素沉着，有没有裂口，如果有裂口，应该观察一下裂口的位置、裂口的种类及个数。
儿童检查要蛔虫病最主要的是进行大便常规检查，粪便涂片中找到蛔虫卵是确诊蛔虫病的有力证据。血常规检查，如果嗜酸性细胞增高，说明患有肠虫病，为诊断提供依据。腹部超生检查，肠系膜淋巴结是否肿大，肠道是否有蛔虫团块，都可以帮助协助诊断。
肛肠检查有常见的有肛门视诊是肛肠检查的第一步。直肠指诊，可以触摸观察是否有直肠息肉、直肠腺瘤甚至一些位置比较低的直肠恶性肿瘤。还有置入肛门镜检查，肛门镜检查可以明确地观察直肠粘膜是否有感染，是否局部存在裂口。