功能性消化不良可采取中成药治疗，一般可以吃大山楂丸、大山楂丸、木香顺气丸等药物。
常用中成药如木香顺气丸、木香顺气丸等理气宽中、消食导滞，对功能性消化不良有良好疗效；此外还可促进胃肠蠕动、改善消化不良症状；枳实导滞丸、枳实导滞丸能理气消积、消食除胀；或还可选用大山楂丸、大山楂丸等消食化积、改善消化不良等。
宝宝呕吐，消化不良一般是由于挑食，偏食或者是暴饮暴食，或者是腹部受冷引起的。也可能是感冒引起的胃肠道症状。首先让宝宝多喝水，调整饮食采取少量多餐，清淡消化饮食，同时给宝宝按摩腹部，一定要保持大便通畅。做一些清淡可口的食物，大米粥，小米粥。调理两到三天左右，慢慢就会好的。
消化不良宝宝应避免进食，可以服用药物改善症状。
孩子的消化不良主要是因为饮食方面的原因，如：暴饮暴食、胡乱喂孩子等，容易造成孩子的消化系统出现问题，增加胃肠的负荷，从而影响到孩子的消化。如果出现了这个症状，可以口服妈咪爱或小儿消积冲剂，这样有助于宝宝的消化功能恢复，同时还可以多吃含有丰富的维生素，例如果汁等。
孕妇出现了消化不良的时候，可以多吃易消化的食物以及促消化的药物。
消化不良通常是指由于胃动力障碍而引起的一组临床症候群，容易出现持续或反复发作腹痛、腹胀、排气多等症状。建议孕妇及时就医，在医生的指导下使用健胃消食片、多酶片等药物缓解症状。平时，要注意少食多餐，保持营养均衡，养成健康的饮食习惯，可以多吃小米粥、南瓜粥等易消化的食物，以及山楂、话梅等开胃的食品。
消化不良胀气的患者可以吃木瓜、芦笋等食物，有利于身体健康。
如果肠胃不好，出现消化不良胀气的情况，可以多吃点补脾、润肠通便的东西。例如木瓜，富含消化酶和纤维素，所以具有良好的治疗便秘的功效。芦笋能降低体内多余的水分，利尿，减轻胃胀。酸奶可以增加肠道中的益生菌，促进肠胃的消化与吸收。姜片具有祛寒、祛气、消炎等功效。
通常来说，宝宝消化不良吃以下食物和药物好，具体分析如下：
首先要注意饮食，避免吃太多油腻的东西，如果是母乳喂养的话，妈妈要注意饮食，少吃肉类、鱼类等食物。其次，可以给孩子适当的使用一些益生菌，比如妈咪爱、酪酸梭菌、双歧杆菌布、地衣芽孢杆菌等。这种益生菌是没有任何副作用的。但是要注意服用方法，要用温凉水服用。同时注意保存方法，要放在冰箱里保鲜层。