头发毛囊炎可以通过以下方式进行治疗：
1.药物治疗：如果患者没有做好头皮的清洁工作，头皮容易滋生细菌，诱发毛囊炎。患者应该在医生指导下使用莫匹罗星软膏、夫西地酸钠软膏、维A酸乳膏等药物进行治疗。
2.一般治疗：患者应该注意不要经常用手去抓挠和刺激头皮，以免造成严重刺激的。注意头部的卫生，勤清洗头发，减少细菌的滋生。
头发毛囊炎通常要以外用杀菌、止痒的药物进行治疗，例如酮康唑洗剂。
头皮的毛囊密度比较高，如果没有做好清洁，容易导致毛囊炎症的发生，会使局部出现红肿痒的症状，因此需要做好头皮的卫生，要勤洗头，避免使用劣质的洗发剂以及护发素，避免去吃辛辣刺激性食物，以免使症状有所加重。
平时还要多喝温水，有利于帮助自身的代谢速度加快。
一般出现毛囊炎，多见于皮肤卫生不好，毛囊出现堵塞炎症等导致，可以使用碘伏消毒，另外可以外用莫匹罗星软膏或红霉素软膏治疗。不要把头发留得过长，注意头部卫生。
可以使用外用药物来进行治疗。若程度较重，可同时应用口服药物。毛囊炎为整个毛囊细菌感染发生化脓性炎症。初起为红色丘疹，逐渐演变成丘疹性脓疱，孤立散在，自觉轻度疼痛。
头皮很容易发生毛囊炎，发生毛囊炎是因为油脂分泌之后毛囊阻塞，外界感染之后发生毛囊炎。所以要尽量减少毛囊炎发生，需要减少油脂分泌，保持局部清洁非常重要，已经发生毛囊炎，尤其是严重的毛囊炎，像穿凿性毛囊炎，或毛囊闭锁三联征，必须要进行治疗，因为严重的毛囊炎有一部分会破坏毛囊，会破坏毛根部的毛囊，毛球会减少或消失，会脱发甚至是永久性脱发，所以必须治疗。