腋下长扁平疣并没有什么危害。
大部分扁平疣对身体健康的影响很小，主要是在美观方面的影响。但是需要注意的是扁平疣属于病毒感染，病情的轻重和患者自身的免疫力息息相关，如果患者的扁平疣久治不愈或反复发作，也是间接提示患者的身体素质比较差、整体健康状况不佳的信号，可以去医院做系统的体检排查其他疾病，比如病毒性肝炎、HIV等。
建议在生活上要注意休息、适当锻炼，提高自身的抵抗力，不和他人共用毛巾、脸盆等生活用品。
扁平疣的危害是，具有传染性，给人造成很大精神压力和情绪影响，它的易传染性造成家人之间产生隔阂，其更大的危害是HPV病毒可致女士发生宫颈癌，据世界卫生组织统计，宫颈癌的发生与人乳头瘤病毒HPV感染密切相关。
扁平疣是由人乳头瘤病毒感染引起的，能引起皮肤和粘膜的鳞状上皮增生，并引起赘生物，在某种程度上具有传染性，但不是性传播疾病。与皮肤免疫力低下有关。可以到皮肤科进行诊断和治疗，并根据医生的指导进行处理。日常需要注意加强锻炼，增强体质。
扁平疣主要危害是影响美观。
部分病人因为HPV十六、十八型感染，后期出现鳞状细胞癌可能性比较高，如果扁平疣已经确诊，建议积极处置，尽快祛除疣体，并且要进行HPV的病毒分形，判断何种类型的病毒，如HPV六型、八型，此种情况发生鳞状细胞癌的几率比较低。
建议患者可以采取冷冻、激光或者局部涂药的方式来去除，疗效都是不错的。平时注意饮食，避免辛辣刺激的食物。
一般情况下，脸上扁平疣可以通过日常护理、使用药物等方式进行处理，具体内容如下：
扁平疣是由HPV感染造成的皮肤疣状增生物，如果出现脸上扁平疣的情况，患者平时应做好个人的卫生护理，避免抓挠患处，以免加重感染的情况，还可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如维A酸乳膏、水杨酸软膏、他扎罗汀凝胶等药物治疗，有较好的治疗效果。