一般情况下，宝宝半夜和早上醒来才咳可能是以下原因导致的：
在深睡的时候，宝宝的大脑皮质会进入充分的休息和深度的压制，从而控制咳嗽的中枢，进而可以有效地控制在深睡觉的时候不会咳嗽，在浅睡的时候，由于大脑皮质的一部份工作，导致咳嗽的作用会降低，从而导致半夜和早上醒来才咳。因此，宝宝半夜和早上醒来才咳，这是因为宝宝的咳嗽反应没有被压制。
小孩半夜醒来满屋跑是梦游症。梦游症俗称"迷症"，是指睡眠中突然爬起来进行活动，而后又睡下，醒后对睡眠期间的活动一无所知。合理安排作息时间，培养良好的睡眠习惯。保持日常生活规律，避免过度疲劳和高度的紧张状态。
小孩子半夜一直咳嗽可能是急性咽喉炎、咳嗽变异性哮喘、急性支气管等疾病引起，建议去医院就诊，在医生指导下针对病因进行治疗。
1.急性咽喉炎：多由受凉导致小孩子黏膜屏障功能下降，从而引起细菌、病毒感染引起，当炎症刺激咽喉时，可出现小孩子半夜一直咳嗽的症状，如果由细菌感染引起，可在医生指导下服用阿莫西林胶囊等药物进行治疗。
2.咳嗽变异性哮喘：如果小孩为过敏体质，半夜接触过敏原时，可能会诱发过敏反应，出现一直咳嗽的情况，可在医生指导下口服氯雷他定糖浆、盐酸左西替利嗪口服溶液等药物进行治疗。
3.急性支气管：多由于细菌感染，导致支气管发生炎症反应，当炎性分泌物刺激咽喉部时，可出现小孩子半夜一直咳嗽的症状。可在医生指导下使用阿奇霉素分散片等控制炎症，同时注意饮食，可选择米粥等清淡易消化的食物，多喝水。
在睡眠过程中出现中间醒来的情况，一方面考虑是由于憋尿所引起的，另一方面考虑可能是做梦惊醒的。如果孩子是憋尿醒来，就要及时给孩子解尿，如果是做梦惊醒，只要孩子不哭闹，体温正常，饮食正常，大小便也正常，并无大碍的，请不必多。
半夜醒来的原因，这是属于失眠，是由于在平时近期压力过大或者是经常胡思乱想，这样就造成中枢神经系统兴奋，时间长就会出现紊乱。所以平时及时去医院进行一下检查，若是属于失眠的情况，那么就需要服用安神补脑液配合调理。
孩子出现哭闹表现，要注意是否有腹痛、消化不良、缺钙、有无惊吓等原因造成的可能，同时也要注意孩子的体温变化，当小孩情绪不稳定的时候也会出现不停的哭闹，可以到当地医院全面检查一下，检查后如果有缺钙饮食方面一定要均衡，多吃一些富含钙元素的食物，比如牛奶。如果有发热的情况，可以使用酒精擦拭颈动脉和腹股沟动脉物理降温。