通常情况下，怀孕初期半夜肚子疼醒可能是先兆流产导致的。具体情况分析如下：
妊娠初期特别是下腹部疼痛，有可能是先兆流产，也有可能是宫外孕，也有可能是肚子受凉，肠胃消化不良。这段时间要注意检查阴道出血情况，保暖后有无缓解。如果病情加重并伴有阴道出血，建议就近就医，B超可以帮助诊断胎儿的发育，并明确病因。
怀孕从早期出现了肚子疼腰疼的情况，引起的原因可能是肠道胀气引起的，这个是正常的表现，另外就是需要考虑到宫外孕的可能的，积极地检查阴道超声，确诊具体的情况以后再进行对症治疗就可以了。
在怀孕初期，孕妇会出现乳房胀大、尿频、轻微的阴道出血等症状，另外还可能会有恶心、头痛、眩晕、情绪不稳定等情况。如果发现以上症状，应及时进行早孕检查，因为患者很有可能已经怀孕了。
孕妇初期怀孕肚子疼的因素如下：
孕妇肚子疼痛的部位如果在骨盆以上，可能是由于自身胃肠道功能有问题，患病因素可能是由于食用辛辣、刺激、寒凉的食物导致的，平时注意饮食清淡，多喝水，注意休息即可逐渐恢复。如果疼痛部位处于骨盆位置，且疼痛症状类似月经来临的情况，可能纯在先兆流产的可能，建议及时前往医院进行B超或是孕酮测验检查，保证胎儿的健康发育。
怀孕初期肚子疼常常是孕囊增大刺激宫缩引起，诊断先兆流产，要给予孕激素类药物抑制宫缩来保胎检查。绝大部分可以保胎成功，也有个别女性腹痛越来越严重，出现阴道出血而流产。建议孕妇应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行检查。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
一般来说，怀孕初期肚子疼正常。
妊娠早期出现轻微腹痛是一种正常的生理现象，因为妊娠后子宫的增大会牵扯到盆底肌肉和韧带，会导致小腹部疼痛。妊娠早期如果有持续的小腹部疼痛、阴道出血等表现，说明有先兆流产的可能，建议立即卧床休息，减少锻炼，同时要让家人尽快到妇产科就诊，在医生的指导下进行必要的检查，再服用孕激素等。